对家族数据的基因检测提高了对导致阿尔茨海默症等复杂疾病的基因检测

贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的一组研究人员开发了一种基于家庭的关联测试，提高了在家族中检测与阿尔茨海默症(Alzheimer’s)等复杂疾病相关的罕见致病基因变体的能力。这种方法被称为罕见变异广义不平衡检验(RV-GDT)，它将罕见的，而不是常见的遗传变异纳入分析。在多名成员受到某种遗传条件影响的家庭中，RV-GDT被证明比其他基于家庭的方法更有效地检测引起这种情况的罕见遗传变异。结果显示在美国人类遗传学杂志．

统计遗传学中心主任、贝勒大学分子与人类遗传学教授、资深作者Suzanne Leal博士说:“像阿尔茨海默氏症这样复杂疾病的遗传性并没有被过去在全基因组关联研究中发现的常见变异所解释。”“随着新一代测序技术的进步，人们对探索罕见变异导致的复杂疾病的原因越来越感兴趣，因此我们开发了RV-GDT，利用家族数据有效地确定这种关系。”

为了说明基于家庭的RV-GDT方法的应用，Leal和同事分析了整体基因组序列数据来自81个有阿尔茨海默氏症病史的家庭。

RV-GDT方法适用于核心家庭和大家庭。它可以分析每个家庭成员的整个基因组，评估家庭内部的联系，并通过整合一级亲属以外的信息和年龄、性别和其他因素，有效地提高分析能力身体质量指数控制:控制混淆

通过开发罕见变异的GDT检测，Leal和他的团队还能够收集基因组感兴趣区域的遗传变异的统计信息，这通常是一个基因。无论缺少基因型数据的群体和谱系的结构如何，RV-GDT方法避免了增加的假阳性。

“当你有多个受影响的人在一个家庭，这很可能是由比你在一般人群中看到的有更大影响的变异引起的。RV-GDT是在扩展谱系中识别复杂性状病因的一种强大方法。”Leal说。

在他们对患有阿尔茨海默氏症的家庭的研究中，研究小组能够通过应用RV-GDT方法确定阿尔茨海默氏症与基因AXIN1和TNK1罕见变异之间的暗示性联系。

Leal说:“尽管TNK1和阿尔茨海默症之间的联系在过去已经被记录为一种常见的变异，但这是第一次将AXIN1和TNK1中的罕见变异联系起来。”“这些发现可能为理解这种疾病及其病因提供新的见解，并可用于未来评估风险。”

作为处理缺少基因型数据的扩展谱系的第一种方法，RV-GDT还可以应用于2型糖尿病、乳腺癌、帕金森症和其他出现在家庭中的心理特征。

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