基因突变的发现可能会促进癌症治疗

据威尔·康奈尔医学院(Weill Cornell Medicine)和纽约基因组中心(new York Genome Center)的研究，一种新发现的、在癌细胞中经常发生的基因突变可能提供关于这种疾病起源的线索，并提供新的治疗靶点。

利用下一代测序技术，科学家们之前已经进行了追踪癌症这种突变破坏了蛋白质的序列。结果，细胞要么产生极度活跃或功能失调的蛋白质版本，要么根本不产生它们，从而导致癌症。1月12日发表的一项研究细胞阐明了一种可能的新驱动因素:DNA序列的小片段(1到50个字母)插入或删除，也称为“indels”，位于基因组中不编码蛋白质的区域。

“这些非编码区域仍然是很重要的,因为它们包含影响基因调控序列,对正常细胞的发展至关重要,”主要作者戈Imielinski博士说,病理学和实验室医学助理教授威尔康奈尔医学和核心成员在纽约基因组中心。“我们已经知道它们在生物学上很重要。问题是它们是否能影响癌症的发展。”

在这项研究中，Imielinski和他的同事分析了来自几个公开的肿瘤样本数据库的测序数据，重点关注98%的不编码蛋白质的基因组。他们最初研究了最常见的肺癌类型肺腺癌，并发现基因组中最常见的indel突变区域位于编码表面活性剂蛋白的基因中。

虽然这些基因对健康的肺功能是必不可少的，但它们以前没有与之相关的肺癌。然而，它们是高度和特异性表达的细胞类型，导致肺腺癌。

研究人员随后观察了其他12种癌症的基因组，并在肝脏、胃和甲状腺肿瘤中发现了类似的模式。

“在每种癌症中，非编码indels聚集在对器官功能至关重要的基因中，但与癌症无关，”Imielinski说，他也是阿尔瓦利德王子殿下计算生物医学研究所计算基因组学的助理教授，也是威尔康奈尔医学院桑德拉和爱德华梅耶癌症中心的成员。

最引人注目的是，这些非编码插入是非常常见的，发生在20%到50%的相关癌症。

“它们发生的频率和最著名的致癌突变一样频繁，”10X基因组公司(10X Genomics)的付费顾问伊梅林斯基(Imielinski)说。该公司销售分析基因信息的设备和技术。“任何以这种频率突变的基因或序列都被证明在癌症中起着因果作用。”如果我们能证明这一点，这将是一个令人兴奋的结果。”

即使这些突变没有被证明会导致癌症，它们也可以在未来被用于改善癌症诊断和治疗。

Imielinski说:“这些突变可以作为生物标记，帮助我们早期诊断癌症，或者当有转移而我们无法找到原发癌症时，它们可以用来确定原发癌症。”“这些发现有很多潜在的临床意义。”

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