川崎病易感性的基因识别
川崎病(KD)是最常见的儿童获得心脏病。治疗,大约四分之一的KD患儿发展冠状动脉aneurysms-balloon-like凸起的心脏血管可能最终导致心脏病、充血性心力衰竭或猝死。
KD的病原体仍然无从风载的病原体是怀疑但同样神秘的就是为什么以及如何一些孩子更敏感。加州大学圣地亚哥医学院的研究人员,与同事雷迪管理学院儿童基因组医学研究所和在伦敦和新加坡,小说进行了全基因组测序的家庭四个孩子中的两个被KD的影响。他们已经确定了合理的基因变异,使一些孩子发展的疾病。
最近发表的研究结果《公共科学图书馆•综合》。
“这是第一个成功的整体分析基因组序列从一个家庭发现新基因与KD敏感性,”资深作家简·c·伯恩斯说,医学博士,教授,川崎病研究中心主任加州大学圣地亚哥分校医学院和瑞迪儿童Hospital-San迭戈。“这一发现是有趣的,因为这种基因,toll样受体家族的一员,编码的蛋白质表达在细胞表面和独特的结合蛋白在细胞外,来自真菌。这可能是一个线索,真菌抗原可能是一个环境引发的疾病。”
KD的患病率增加儿童在亚洲、美国和西欧。在日本,发病率最高的国家:306年每100000 5岁以下儿童,超过每年新发病例达14000。每60名男孩和每75名女孩在日本期间将开发KD的童年。
发病率在美国lower-9 19岁以下儿童每100000 5日上涨,至少在圣地亚哥县。预测模型估计,到2030年,每1600美国成年人会受到疾病的影响。
KD有一个明确的基因联系。这是最常见的在美国在亚洲或非洲血统的人,但其遗传学是复杂的,研究人员很难确定哪些基因变异和组合导致一些孩子发展疾病。伯恩斯和他的同事们雇佣的全基因组序列分析第一次检查一个六人非裔美国人的家庭时,两名儿童在KD,但父母和其他兄弟姐妹没有。
“尽管他们的易感性明显增加,非裔美国人血统的孩子已经被排除在先前的KD遗传分析,”作者写道。
关键在使用的工具是全基因组测序,这一过程中,一个人的基因组的完整DNA序列在一个确定的时间。研究人员还看着全基因组关联研究,寻找基因变异在庞大的人口。目标是找到,如果可能的话,不同的基因变异,在组合,可能表示倾向和更高的发展KD的可能性。
研究人员发现6 toll样受体基因的一种变体,在免疫系统中起着重要的作用,这可能与炎性状态在KD的急性期。之前的研究没有发现这个基因作为影响易感性KD。
此外,另一个变异的基因与肿瘤有关的钙信号传感器2、参与细胞钙信号,突出显示。作者说TACSTD2的进一步研究是必要的。
伯恩斯说,研究中,其分析方法和使用基因组测序代表了一个新的方法,揭示相关基因变异不仅在家庭中受到KD,但许多其他复杂的遗传疾病。
“整个基因组序列的分析理解疾病遗传学是最近才成为一个工具,是负担得起的和可控的由于计算机科学的新发展。我们兴奋的是学习如何利用这种分析研究我们的力量孩子们”,伯恩斯说。
“我们的下一个方法将从KD整个基因组序列比较严重心脏损害那些没有损害患者尽管没有或延迟治疗。我们希望这次交易将使我们的遗传途径导致冠状动脉损伤,进而将建议针对这些通路的新疗法。”
更多信息:Jihoon金et al。全基因组测序的一个非洲裔美国人家庭强调toll样受体在川崎病易感性6变种,《公共科学图书馆•综合》(2017)。DOI: 10.1371 / journal.pone.0170977