分析基因拷贝为卵巢癌提供了新的治疗可能性

加州大学圣地亚哥分校医学院和摩尔斯癌症中心的18名研究人员开发了一种新工具来分析癌症遗传学中经常被忽视的一个方面，即导致基因副本丢失或获得的突变。这种被称为体细胞拷贝数改变的变化，可能是疾病进展的关键，并可能为卵巢癌和其他恶性肿瘤提供新的治疗方法。

“当大多数人认为癌症遗传学,他们考虑单一关键突变促进肿瘤formation-very特定BRCA基因,”乔·r·德莱尼说,博士,一位在临床翻译项目穆尔斯癌症中心和加州大学圣地亚哥分校的第一作者,这篇论文是发表在2月15日自然通讯。“这些变化通常被称为肿瘤驱动因素，但这不是影响癌症生长的唯一偏差。我们探索了其他可能性。”

癌症细胞中超过90%的基因变化涉及单个基因拷贝的丢失或获得，而不是突变。一个肿瘤细胞可能有一个或三个副本，而不是正常的双亲各提供一个的两个副本。这一领域尚未深入探索，因为其他疾病的经验告诉科学家，一个基因副本的丢失可能不会导致疾病症状，因为由另一个父母提供的第二个副本可以填补。

Delaney和他的团队想知道，如果有几个具有相同细胞功能的单基因副本丢失了，这是否属实，以及不同癌症的模式可能是什么。该团队设计了单倍不足/三倍敏感基因(HAPTRIG)计算工具，以识别因基因丢失和获得而明显中断的通路。

卵巢癌尤其充满了这些变化——超过60%的基因受到影响。当研究小组使用HAPTRIG分析这种恶性肿瘤时，最突出的途径是自噬——一种帮助维持正常细胞健康的细胞死亡的自然过程。卵巢癌症细胞一直使用自噬，但也会失去几个自噬基因的副本，导致能力受损。

研究人员随后结合使用了美国食品和药物管理局批准的现有药物来靶向自噬，并发现卵巢癌在几种不同的小鼠癌症模型中，细胞对这些药物高度敏感，甚至在对标准化疗有耐药性的细胞中也是如此。该研究的资深作者、Moores癌症中心妇科肿瘤科副教授Dwayne G. Stupack博士说，与标准化疗相比，药物组合的毒性较小，相对便宜，应该进行临床评估。

作者说，随着进一步的工作，这一发现可能会导致治疗化疗耐药性疾病的新方法，也可能会加强对其他癌症的治疗。

“我们的研究表明，肿瘤中靶向基因变化的路线图不应局限于突变，”斯图帕克说。“HAPTRIG可能揭示了跨癌症类型的其他靶向途径。我们提供了免费的网络工具允许社区轻松地对21进行HAPTRIG分析癌症类型。”

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