新的统计分析揭示了数千种与癌症相关的罕见突变

新的统计分析揭示了数千种与癌症相关的罕见突变
肿瘤结构域热点的描述发现与蛋白激酶结构域的活性部位有明显的重叠。资料来源:原图由Thomas A. Peterson制作,CC by

科学家们已经确认了数千个以前被忽视的基因突变,这些基因突变虽然罕见,但很可能导致癌症的生长。该发现可能有助于为新的治疗方法铺平道路,发表在《科学》杂志上PLOS计算生物学

遗传时癌症出现在细胞中引起异常生长从而导致肿瘤。一些抗癌药物利用这一技术来攻击肿瘤细胞,它们以蛋白质为目标,这些蛋白质因编码它们的基因发生突变而发生突变。然而,在所有导致癌症的突变中,只有一小部分被确认。

托马斯彼得森,在马里兰州大学和同事开发了一种新的统计分析方法,使用来自癌症患者的遗传数据来寻找癌症突变。与以往的研究相比,重点是个体基因中的突变,新方法解决了相关蛋白质的家庭共享的类似突变。

具体地,新方法侧重于称为蛋白质的子组分中的突变域名。尽管不同的基因编码它们,但不同的蛋白质可以共享常见的蛋白质结构域。新策略借鉴了蛋白质结构域结构的现有知识,并在蛋白质结构域内定位位置,其中突变更容易在肿瘤中发现。

使用这种新方法,研究人员鉴定了数千种罕见的肿瘤突变,其在其他肿瘤中在其他蛋白质中发现的突变发生在同一个域位置 - 表明它们可能参与癌症。

“也许只有两名患者的特定蛋白质发生了突变,但当你意识到它在完全相同的位置研究的资深作者Maricel Kann说,“你会意识到调查这两种突变是很重要的。”

研究人员创造了“onCodomain”一词来参考更有可能含有癌症的突变。进一步研究鞘膜瘤可以有助于提供推送药物发展:“因为域在这么多蛋白质中都是一样的,”KANN说,“有可能的单一治疗可以解决由广谱突变的蛋白质引起的癌症。”


进一步探索

新的突变可能与非裔美国人的前列腺癌相关联

更多信息:Peterson TA, Gauran IIM, Park J, Park D, Kann MG(2017)肿瘤结构域:一种以蛋白结构域为中心的框架,用于分析肿瘤样本中的罕见变异。PLOS计算BIOL.(4): 13 e1005428。doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005428
信息信息: PLoS计算生物学

引文:新的统计分析揭示了数千种与癌症相关的罕见突变(2017年4月20日),2021年4月25日从//www.puressens.com/news/2017-04-statistical-analysis-reveals-thousands-rare.html检索
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