研究人员回家于透明细胞子宫内膜癌的突变谱
在迄今为止规模最大的透明细胞子宫内膜癌(CCEC)基因组学研究中,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)的研究人员及其合作者发现了TAF1基因的突变。他们还证明,CCEC肿瘤的突变谱有时类似于其他类型的子宫癌,即浆液性子宫内膜癌或子宫内膜样子宫内膜癌。该研究于2017年5月9日发表在该杂志上癌症。
子宫内膜癌症是最常见的妇科癌症,患有超过8,000名美国女性和76,000名全球每年死亡的女性。幸运的是,最常见的子宫内膜癌,子宫内膜子宫内膜癌,倾向于早期诊断,并且通常对治疗良好;五年的相对存活率在一项研究中报告为91%。然而,患有CCEC或静脉内膜癌的妇女均罕见的子宫内膜癌,通常具有较差的临床结果:一项研究报告称,CCEC的女性具有65%的妇女的65%,患有浆液性癌症的妇女有一个五年相对生存率为45%。
“基因组突变NHGRI癌症遗传学和比较基因组学分支的资深作者和高级研究员达芙妮·w·贝尔博士说:“透明细胞子宫内膜癌的发病机制因人而异。”“由于癌症通常是在子宫外扩散后才被诊断出来的,死亡率高得令人无法接受。我们正试图建立一个知识库,破解导致这些癌症的基本基因组变化。”贝尔博士和她的团队专门从事基础研究,旨在识别肿瘤中发生突变(改变)的基因病人具有临床侵略性的子宫内膜癌。
贝尔博士和她的团队从肿瘤细胞和来自CCEC患者的正常细胞中分离DNA。他们的目标是鉴定来自正常的CCEC肿瘤细胞中的基因突变细胞。该团队在肿瘤和正常DNA的蛋白质编码区域中测序了exome,构建块(核苷酸),从16名CCEC患者中发现了222个基因中的突变。该团队将该列表的222个基因列表缩小为22“兴趣基因”,其代表在一个以上CCEC患者中突变的基因,以前涉及的CCEC中的基因和/或在透明细胞卵巢癌中突变的基因。该团队进一步搜索了这两种基因的突变瘤另外47名CCEC患者的DNA。他们的结果确定了在最大的CCEC患者组中先前涉及CCEC的基因(TP53, PPP2R1A, PIK3R1, SPOP, PIK3CA, ARID1A和FBXW7)的突变频率。
他们还发现了TAF1基因的突变,这是一种以前没有涉及到CCEC的基因。TAF1编码转录因子复合体的一部分,调控其他转录因子的表达基因在整个基因组。此外,研究人员观察了CCEC患者肿瘤的基因突变模式,发现大量的CCEC类似浆液性子宫内膜癌或子宫内膜样子宫内膜癌。
这些发现揭示了潜在的基因组变化,这可能是推动CCEC发展的重要因素,CCEC是一种罕见但临床上具有侵袭性的形式子宫内膜癌。
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