单核RNA测序，通过液滴液滴

去年广泛的研究人员描述了一种称为SNUC-SEQ的单核RNA测序方法。该系统使研究人员能够研究难以分离的细胞类型的基因表达谱以及来自存档组织的细胞。现在，一个广泛的团队已经克服了一个关键的绊脚石块，以Snuc-SEQ的广泛使用：Scale。

发表在自然方法博士后Naomi Habib、Inbal Avraham-Davidi和Anindita Basu;核心成员张锋和Aviv Regev;和他们的同事揭示了DroNc-Seq，一种融合了sNuc-Seq和微流体的单细胞表达谱技术，允许大规模平行测量结构复杂的组织中的基因表达。

研究人员过去努力在单细胞水平下研究神经元和脑中的复杂组织中的神经元和其他细胞中的表达。这是因为分离细胞的程序影响其RNA含量，并且并不总是准确地捕获样品中存在的细胞类型的真实比例。此外，该程序不适用于冻结的组织。Snuc-SEQ通过使用从细胞提取的单个核代替从细胞提取的核来绕过这些问题。

然而，sNuc-Seq是一种低通量技术，使用96孔或384孔板收集和运行样本。为了将该方法扩大到一次有效研究数千个原子核所需的水平，该团队转向了微流体技术。他们的灵感来自Drop-Seq，一种单细胞RNA-seq (scRNAseq)技术，它将单细胞与DNA条形码珠封装在微滴中，从而大大加快了表达谱实验的速度并降低了成本。

为了测试新的方法的准确性和速度，该团队使用鼠标细胞系和小鼠脑成功地将Dronc-SEQ与Drop-SEQ，SNUC-SEQ和其他下吞吐量SCRNASEQ方法成功进行了基准。组织。他们还将其应用于基因型组织表达(GTEx)项目收集的人类脑组织，发现他们可以a)识别神经元和胶质细胞特有的表达特征细胞和其他细胞类型在大脑中(包括稀有类型)，以及b)区分密切相关的细胞亚型。

Dronc-SEQ的鲁棒性和准确性表明，对于稳定的技术被用作人类细胞阿特拉斯的一部分和其他基于ScrnaLe的努力，这可能是一个有价值的补充。

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