研究人员利用软件预测可能成为免疫靶标的肿瘤标记物
北卡罗来纳大学莱因伯格综合癌症中心的科学家们开发了一种软件程序，可以准确预测哪些肿瘤特异性标志物将出现在接受干细胞移植的患者的白血病细胞表面。研究人员计划利用他们的发现开发针对白血病患者这些抗原的免疫疗法。
研究人员在12月9日星期六在亚特兰大举行的第59届美国血液学年会上报告说，他们能够在一组血癌患者身上验证他们预测标记物的方法——称为小组织相容性抗原。初步发现是利用软件预测开发白血病免疫疗法的整体计划的早期步骤。
“如果你能识别并激活只针对目标的免疫细胞白血病细胞而不是正常的健康细胞，这将是一个巨大的胜利，”北卡罗来纳大学莱恩伯格分校的本杰明·文森特医学博士说，他是北卡罗来纳大学医学院血液学/肿瘤学部门的助理教授。“我们已经开发了一个软件包，可以根据DNA和RNA测序预测任何患者的白血病特异性免疫靶点。我们下一步的工作是利用这些信息进行患者特异性治疗，试图在不加重移植物抗宿主病的情况下提高治愈率。”
癌症是一种遗传疾病，其中DNA错误有助于驱动异常细胞生长。当突变或其他基因变化发生时，有时细胞的机制会读取并将这些错误转化为独特的异常蛋白质癌症细胞。这是白血病患者免疫反应的一个可能靶点来源。在干细胞移植的背景下，干细胞供体和患者之间的遗传差异也可以提供免疫靶点。研究人员假设他们可以进行排序癌症细胞而不是正常细胞的DNA和RNA来识别这些目标，这一过程需要文森特实验室开发定制的生物信息学软件。
在一项回顾性研究中，研究人员测试了他们的软件是否可以预测101名接受了同种异体干细胞移植(使用供体进行移植)的血癌患者的抗原靶点干细胞．他们鉴定出16种已知的次要组织相容性抗原。此外，他们还预测了100多种新的抗原靶点。
展望未来，研究人员希望利用他们的软件开发几种针对这些预测抗原的治疗方法。在一项提案中，他们的目标是改进干细胞移植这是治愈许多人的最好机会病人患有高危血癌。文森特说，他们有可能利用他们的预测来设计捐赠者的免疫系统细胞特异性靶向癌细胞抗原，同时预防移植物抗宿主病，其中免疫细胞攻击健康组织。
文森特说:“我们已经开发出一种新的计算方法来预测白血病特异性抗原。”“最大的收获是，我们现在可以开发针对这些抗原的个性化细胞疗法，我们假设这些抗原将增加白血病的治愈，而不会引起移植物抗宿主病。”
