新的计算方法揭示了药物耐药的靶点

大阪 - 在癌症中，最重要的特征之一是脱氧胞菌菌甲基化以形成5-甲基胞嘧啶（5MC）。DNA甲基化是将甲基（由三种氢原子组成的有机化合物的结构单元与碳原子组成）加入到DNA分子中。

已经显示5MC的发生和分布模式对基因调控至关重要，可作为诊断的重要生物标志物。因此，研究DNA甲基化和转录之间的关系（基因表达的第一步）对于解释细胞反应和新型治疗策略的发展是重要的。

广泛的DNA甲基化和转录分析提供了大量数据;但是，很难识别关键基因与这些数据的癌症发展有关。为此，大阪大学研究人员团队将大量数据转换为使用高斯函数从数据中提取适当的信息，以作为5MC甲基化的代表值的信息提取适当的信息。

该研究报告的第一作者Masamitsu Konno解释说:“肿瘤包含一种被称为癌症干细胞(CSCs)的细胞亚群，这种细胞具有自我更新和致瘤性，并在化疗和放疗的耐药性中发挥作用。科学报告。“因此，我们旨在确定确定治疗靶点的有效方法，使用基于5mC的酶鸟氨酸脱羧酶的CSC模型来描述细胞内事件。”

新的计算方法整合了基因表达水平和甲基化修饰数据，这使得研究人员能够成功识别TRAF4作为一个重要的耐药基因。通过该方法，还确定了药物对包括食管癌在内的人胃肠道肿瘤的疗效。TRAF4的异常表达已在某些癌症中被报道，包括乳腺癌、肺癌和前列腺癌，但这是首次表明TRAF4可能对人类食管癌CSCs的功能有重要调节作用的研究。

通讯作者Yuichiro Doki说:“我们的数学方法可以用来同时量化和识别胃肠道肿瘤干细胞中潜在的化疗耐药靶点。”“我们的研究结果不仅为食道新疗法的开发提供了有价值的信息癌症，但他们还支持CSC药物发展疗法的大规模筛选的理由。“

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