破冰船的蛋白质打开基因组T细胞的发展,研究人员发现

几乎所有人体细胞有相同的DNA序列,但有200多细胞类型有不同的大小,形状和化学成分。确定基因组的哪些部分是阅读使蛋白质和沉默是由称为转录因子的蛋白质。这些规范的可用性不同的DNA表达而不是其他仍埋在盘绕紧密结构称为染色质。

佩雷尔曼医学院的研究人员在宾夕法尼亚大学,描述在本周免疫力转录因子的作用称为TCF-1目标凝聚染色质在t细胞发育和调节基因组序列的可用性。新TCF-1和染色质之间的联系将帮助开发新疗法使用表观遗传药物来改变癌症中t细胞的命运,自身免疫性疾病和感染性疾病。

资深作者高Vahedi博士的遗传学助理教授,她在计算生物学多学科培训,表观遗传学,免疫学,t细胞身份的问题。她领导一个多学科小组积分计算和实验的方法来开发一个理解免疫的基因调控细胞。Vahedi也是一个宾夕法尼亚大学免疫学研究所和表观遗传学研究所成员。

她把TCF-1比作一艘破冰船船最初打开冰(染色质浓缩、封闭),使可供其他船只(其他的道路转录因子在后来的发展阶段)的蒸汽通过现在打开水(解除染色质)。TCF-1最终打开染色质DNA可以读取蛋白质,也使染色质开放,以便后续因素可以访问指导成熟T细胞DNA制造蛋白质,其最终的身份。

尽管TCF-1在T细胞功能的重要性已经超过25年了,这种蛋白质的机制控制T细胞的身份仍然未知。开放和封闭区域的团队生成一个概要文件在8 t细胞发育阶段,发现大量的基因组的转录因子TCF-1地区最早开放的发展阶段。

“我们实验室有兴趣了解t细胞建立身份,“Vahedi说。“我们选择研究T细胞,因为它们最重要的角色在巡逻身体清除细菌和癌细胞等其他危险。”

他们建立了identity-making角色TCF-1通过删除在小鼠模型,发现大多数开放网站关闭,在紧紧缠绕染色质变得无法访问。另一方面,当他们TCF-1到一种常见的皮肤细胞,它是“破冰”,打开封闭的区域通过消除化学组收紧染色质。细长的纤维母细胞重新编程更加T-cell-like形状和数以百计的t细胞基因也在这些皮肤细胞中表达。

使用计算和外遗传性方法,研究小组发现,TCF-1表现以类似的方式在单个T细胞的染色质。因为许多细胞之间的一致性,他们得出的结论是,TCF-1控制t细胞命运的决定是至关重要的细胞将成为什么。

“我们展示了TCF-1控制T细胞命运通过封闭的染色质的能力目标和建立发展中T细胞的身份,“Vahedi说。“TCF-1许多免疫学和肿瘤研究的焦点,尤其是处理检查点抑制剂和生病免疫细胞。我们认为的“破冰”能力TCF-1可以有选择地利用重置‘老’T细胞“年轻”的状态,这样他们就可以对抗侵略者。”

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