非编码DNA中的变体有助于继承自闭症风险

基因
信用:CC0公共领域

近年来,研究人员已经坚定地认为,首次出现的基因突变,即新生突变,是大约三分之一的自闭症谱系障碍(ASD)病例的原因。在一项新的研究中,一个由加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的科学家领导的国际团队已经确定了一个可能解释剩余风险的罪魁祸首:非编码DNA区域的罕见遗传变异。

调查结果在线发布于2018年4月20日问题科学

新发现的危险因素与已知的不同有两个重要的方面。首先,这些变异并不直接改变基因,而是破坏了邻近的DNA控制元件,这种控制元件可以开启或关闭基因,称为顺式调节元件(cis-regulatory elements,简称cre)。其次,这些变异在自闭症儿童中并不是作为新的突变出现,而是从他们的父母那里遗传来的。

“十年来,我们众所周知,自闭症的遗传原因部分地包括基因蛋白质序列中的脱诺突变”朱森斯·塞巴特(UC San Diego医学院)的精神病学,细胞和分子医学和儿科教授Jonathan Sebatob体育开户网址伯斯特精神科基因组学基因组学中心的主任。“然而,基因序列仅占基因组的2%。”

为了调查ASD患者其余98%的基因组,Sebat和他的同事分析了2600个家庭的9274个受试者的完整基因组。其中1000个在圣地亚哥的人类长寿公司(HLI)和Illumina公司进行了测序,DNA序列在加州大学圣地亚哥分校的圣地亚哥超级计算机中心进行了分析。这些数据随后与来自Simons Simplex Collection和Autism Speaks MSSNG全基因组测序项目的其他大型研究相结合。

然后,研究人员分析了结构变异,删除或复制的DNA片段,破坏的调节元件被称为CRE-SVs。研究人员从家族的完整基因组中发现,遗传自父母的cre - sv也导致了ASD。

“我们还发现CRE-SV主要来自父亲,这是一个令人惊讶的父亲,”博士博士博士威廉姆曼德勒,博士学位,博士,SEBAT的博士学者,博士博士,在HLI的BIOINFORMATICS科学家SEBAT的实验室。

“之前的研究发现,一些蛋白质编码变体主要来自母亲,这是一种称为母体起源效果的现象。我们对非编码变体的父母起源效果表明,来自母亲和父亲的遗传遗传贡献可能是定性不同。“

塞巴特说,目前的研究并不能确定地解释是什么机制决定了这些亲本效应,但他提出了一个合理的模型。

他说:“人口中存在广泛的遗传变异,具有较强的效果和非分量变体具有较弱的效果的遗传变异”。“如果男女宽容容忍这种变异的能力,这可能会产生我们所看到的原产地的父母。”


进一步探索

导致自闭症的基因变化比以前认为的更加多样化

更多信息:患者遗传性的顺式调节结构变体与自闭症有关,科学(2018)。DOI: 10.1126 / science.aan2261
信息信息: 科学

引文:非编码DNA的变异有助于遗传自闭症风险(2018年4月19日
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