新的视网膜神经节细胞亚型出现在单细胞RNA测序

单细胞测序技术正在填补生命目录中的细节。康涅迪克大学健康中心(UConn Health)和杰克逊实验室(Jackson Laboratory)的研究人员已经鉴定了视网膜神经节细胞(RGCs)的40种亚型，以及区分它们的遗传标记和转录因子。

由于基于液滴的单细胞RNA测序技术的最新进展，研究人员现在可以分离单细胞细胞并扩增它们的遗传物质以探测它们的全部RNA。这使得可以在给定类型（例如，RGCS）的细胞的详细人口，鉴定构成亚型的细微分子差异。

RGCS将视觉数据从眼睛传达给大脑，并先前已经确定了30个亚型。使用单细胞RNA测序，研究小组分析了6,225个RGC，从新生小鼠的左眼和右眼检测到每种细胞的约5,000个基因。通过群集算法运行生成的数据导致将单元格的分类为40个子型。

Ephraim F.Trakhtenberg，Ph.D.，Uconn Health的神经科学部带来了研究团队，其中包括Paul Robson，Ph.D.，单细胞生物学的JAX总监。他们的研究，发表在自然通讯，为生物学中的大问题提供新的精确度：什么构成细胞类型或亚型？

哺乳动物的中枢神经系统是高度复杂的，涉及到许多专门的神经元类型和亚型的相互作用。研究小组之所以选择RGCs，正是因为到目前为止，与任何其他主要的神经元细胞类型相比，RGCs的亚型已经被识别得更多，而且其他种类的视网膜细胞类型(如光感受器)已经在单细胞水平上进行了研究。他们的目标是阐明RGC亚型之间的分子差异和独特的标记。

除了识别新的RGC亚型及其标记外，研究人员还展示了将它们区分为亚型所需的细胞间基因表达的多变性，并提出了从细胞类型群体到亚型的层次结构。该研究的数据集可通过用户友好的康州大学健康网站应用程序RGC Subtypes Gene Browser公开获得。

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