研究人员预测常见的致命疾病的风险从数以百万计的遗传变异
Broad研究所的一个研究小组麻省理工学院和哈佛,麻省总医院(MGH)和哈佛医学院报道一种新的基因组分析,可以确定大分数的人口有更高的患严重的常见疾病的风险,包括冠状动脉疾病、乳腺癌和2型糖尿病。
这些测试,从基因组中数以百万计的地方使用信息来确定风险五疾病,可以标志的可能性更大发展中潜在的致命的条件在任何症状之前出现。虽然研究的数据来自英国,它表明,多达2500万人在美国可能会超过三倍的正常风险冠状动脉疾病,还有上百万的儿童可能在其他条件相似的风险,基于遗传变异一个人。基因组信息可以让医生特别注意关注这些人,也许使早期干预防止疾病。
研究提出了重要的问题关于这个方法,称为多基因风险评分,应进一步发展和在医疗系统中使用。此外,作者指出,基因检测在很大程度上是基于从欧洲血统的人的信息,结果凸显了其他民族的需要更大规模的研究,以确保公平。这项研究发表在自然遗传学。
长时间“我们知道有些人有高危疾病只是基于整体遗传变异,”资深作者说Sekar Kathiresan,协会成员和心血管疾病倡议主任Broad研究所,以及基因组医学中心主任在MGH和哈佛大学医学院的医学教授。“现在,我们可以衡量风险使用基因组数据以一种有意义的方式。从公共健康的角度来看,我们需要确定这些高风险人口,所以我们可以提供适当的照顾。”
Kathiresan领导与第一作者Amit诉Khera, MGH心脏病专家和青年教员Kathiresan的实验室,和计算生物学家马克·查尔Kathiresan的实验室。
发展得分疾病风险的算法,研究人员们就首次从大规模的全基因组关联研究收集数据来识别与冠状动脉疾病相关的遗传变异,心房纤维性颤动、2型糖尿病、炎症性肠病、乳腺癌。对于每一个疾病,他们应用了计算算法结合信息从所有的variants-most单独有一个非常小的影响风险分散到一个号码,或多基因风险评分。这个数字可以用来预测一个人的这些疾病的几率基于他或她的基因。
测试和验证多基因风险评分算法的数据超过400000个人在英国生物库,一个广泛的基因组数据库数据和医疗信息从参与者的英国血统。
重要的是,根据Khera,多基因冠状动脉疾病的风险分数高的人并不一定表现出其他疾病风险预警信号(如高血压或高胆固醇)。
”这些人,他在几次正常的心脏病发作的风险只是因为许多添加剂影响的变化,主要是在雷达下飞行,”他解释道。“如果他们来到我的临床实践,我无法选择他们作为高风险与我们的标准指标。确实需要确定这些病例中我们可以更有效的筛查和治疗目标,和这种方法给我们提供了一个潜在的出路。”
的比分为冠状动脉疾病:工作中仔细研究了超过660万个地点的算法基因组估计一个人的发展致命疾病的风险,这是最常见的成人心脏病和死亡的一个主要原因,在美国。个人的英国生物库数据集,8%是三倍以上可能患该病与别人相比,基于他们的遗传变异。从绝对意义上讲,只有0.8%的患者非常多基因风险最低分数有冠状动脉疾病,而11%的人得分最高。
为乳腺癌女性malignancy-related死亡的主要原因,多基因预测发现,1.5%的英国生物库人口三倍以上的疾病的风险相比其他人。非常的多基因风险得分最高的五倍risk-meaning,按绝对值计算,有19%的人得分最高乳腺癌约4%,而其余的人。研究人员类似的方法应用于多基因2型糖尿病的风险评分,心房纤维性颤动炎症性肠病。
开发多基因风险评分测试其他常见疾病,研究小组指出,进一步的研究将需要收集全基因组关联数据和验证分数参考生物银行。此外,当前的多基因风险的计算主要是来自基因研究在欧洲ancestry-so的人需要更多的研究来优化算法对其他民族。
尽管如此,研究人员提出,这是时间生物医学社区考虑包括临床护理的这种方法。要做到这一点,需要考虑很多因素,如:疾病是否有遗传因素;如果疾病普遍存在足够的普通人群筛查价值纳入常规临床护理;如果知道疾病的遗传风险将是有用的在指导保健来抵消这种遗传风险。
“最终,这是一种新型的遗传风险因子,”Kathiresan说。“我们设想多基因风险分数来确定人在高或低风险的疾病,也许早在出生,然后使用这些信息为目标interventions-either生活方式修改或治疗预防疾病。对于心脏病,我预见到每个病人将有机会知道他或她的多基因风险数量在不久的将来,类似于现在他们可以知道他们的胆固醇数量。”
更多信息:阿米特诉Khera et al,全基因组的常见疾病识别个人得分多基因风险相当于单基因突变,自然遗传学(2018)。DOI: 10.1038 / s41588 - 018 - 0183 - z