用于阻止感染爆发的DNA测序和患者数据

牛津大学医院(OUH) NHS基金会信托的临床和研究团队利用感染预防和控制最佳实践、全基因组测序和电子患者数据，在检测到多用途患者设备是罪魁祸首后，阻止了一种潜在致命真菌病原体的爆发。

约翰·拉德克里夫医院的这一突破意义重大，因为这是首次在清楚了解病因的情况下，完全结束了耳念珠菌(C. auris)的爆发。

这项研究发表在新英格兰医学杂志该研究由英国国立卫生研究院(NIHR)、牛津大学纳菲尔德医学系、大数据研究所、英国国立卫生研究院(NIHR)健康保护研究所和英国公共卫生部的感染、预防和控制及神经科学重症监护病房(ICU)小组开展，并得到英国国立卫生研究院牛津生物医学研究中心的支持。ob欧宝直播nba

首席研究员、大数据研究所(Big Data Institute)传染病研究员戴维·艾尔(David Eyre)博士说:“我们的研究阻止了金耳线虫的爆发，这是非常令人高兴的。”在英国和世界各地，有很多医院都无法阻止疫情的爆发。弄清楚它是如何传播的应该有助于控制它在世界范围内的传播。

“这就是这种病原体的性质，我们必须保持警惕。我们很高兴地看到，由于我们的发现改变了我们的方法，我们没有发现进一步的病例。”

耳梭菌是一种新兴的，多药耐药真菌病原体，最近与世界各地的暴发有关，通常在重症监护病房。在一些病人， C. auris可以进入血液并扩散到全身，导致严重的感染。

研究人员调查了2015年至2017年在约翰拉德克里夫医院神经科学重症监护室爆发的大规模耳梭菌疫情，在这期间有70名患者被确定为耳梭菌感染或被感染。

利用对患者和环境分离物的全基因组测序，结合电子健康记录数据，他们研究了可能的传播途径、定植的风险因素和疫情的分子流行病学。

神经科学重症监护室的患者定期筛查耳梭菌，邻近神经科学病房的患者也一样。我们还从环境中采集了样本，重点是采集高接触区域和多用途设备。

“我们发现，auris在一般环境中很少被发现;在仪器内部的表面上没有这种微生物的痕迹，16份空气样本中只有1份呈阳性。”Dr. Eyre解释道。

“然而，我们确实在多用途病人设备上发现了auris，特别是温度探头。从患者身上分离出的耳氏梭菌与这些体温计之间存在密切的基因匹配。我们发现，用其中一种探针监测它们的温度是获得金耳梭菌的一个重要风险因素。与艰难梭菌等病原体不同，床的接近程度似乎不是传播的因素。

“因此，我们的研究清楚地表明，环境的生存似乎是念珠菌在医疗环境中的持续和传播的关键。这导致我们成功实施了感染控制措施，以遏制艾滋病毒爆发-包括停止使用多功能体温计。”

德里克·克鲁克教授是英国公共卫生部国家感染服务中心主任，同时也是英国国立卫生研究院牛津生物医学研究中心抗菌素耐药性主题负责人。他说:ob欧宝直播nba“这项研究将直接纳入有关多用途设备使用的医疗指南，特别是在未来爆发疫情时对这些设备进行消毒。

“尽管在牛津大学的研究中，有相对少数的患者具有临床意义的耳梭菌感染，但这种感染可能会对重症监护病房的脆弱患者造成严重后果，特别是因为耳梭菌对许多抗真菌药物具有高度耐药性。”这项研究结果所采取的行动无疑阻止了更多的病人被殖民和感染。”

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