微生物组分析揭示了与溃疡性结肠炎的严重程度和治疗的关系
一项对400多名儿童肠道微生物的研究指出了这种炎症性肠病中微生物组的行为。
胃肠道承载着一系列复杂的关系，包括各种宿主细胞(如上皮细胞、免疫细胞)和阵列微生物它们在肠道内安家(统称为肠道)肠道微生物组)．溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病疾病在美国，这些关系被研究人员尚未完全掌握的机制所打断，但在这些机制中微生物组可能会发挥关键作用。
为了更好地了解微生物在UC进展和治疗中的作用，由计算科学家Melanie Schirmer和布罗德传染病和微生物组项目(IDMP)的核心研究所成员Ramnik Xavier领导的多中心团队对405名UC儿童在确诊后一年的肠道微生物群进行了分析。
通过将全面的健康记录与16s rRNA扩增子测序结合在一起(一种测序方法，提供样本中所有微生物的快照)，研究小组发现了微生物组组成的明确模式，随着时间的推移，追踪疾病的严重程度和治疗反应。他们的研究结果发表在细胞宿主和微生物．
“大部分微生物组分析工作与溃疡性结肠炎他是IDMP和麻省理工学院微生物信息学和治疗中心(CMIT)的联合主任。他还指导马萨诸塞州总医院计算和综合生物学中心。“这项研究帮助揭示了儿童UC中treatment-naïve微生物组的特征，并确定了微生物组和难治性疾病之间的联系。”
总之，研究人员将50种微生物的丰度与疾病诊断时的严重程度联系起来。他们还发现，随着时间的推移，微生物丰度的变化与儿童的疾病是否对标准疗法有反应有关。这包括一项令人惊讶的发现，患有严重UC的儿童体内的微生物群异常丰富，这些细菌通常存在于口腔中，会加剧UC患者的炎症。
研究小组还注意到UC患者的某些微生物靶向抗体水平发生了变化。这些变化也与疾病严重程度他认为免疫系统和某些肠道微生物可能会影响孩子的病情是否会随着时间的推移恶化或改善。
作者指出，他们不能说他们发现的模式是否有助于导致UC。然而，他们的研究结果表明，微生物群可能作为UC治疗的治疗资源，作为预测患者临床过程的生物标志物，并用于计划和监测治疗。
Schirmer和Xavier的团队在PROTECT的赞助下进行了他们的分析，PROTECT是美国国立卫生研究院支持的一项研究，旨在更好地了解新诊断出UC的儿童对标准初始治疗的反应。
