Blue Brain Project发布第一个数字3d脑细胞图谱

蓝脑项目发布第一个数字3D脑细胞图谱
Blue Brain Project发布第一个数字3D脑细胞图谱。Credit: Credit The Blue Brain Project

第一个老鼠大脑中每个细胞的数字3-D图谱为神经科学家提供了以前无法获得的所有737个大脑区域的主要细胞类型、数量和位置的信息——这可能会大大加快脑科学的进展。发布的EPFL的蓝脑计划并发表在计算神经科学前沿,蓝色脑细胞图谱整合来自数千个全脑组织染色的数据,成为一个全面、互动和动态的在线资源,可以不断更新的新发现。这一开创性的数字图谱可以用于分析和进一步建模特定的大脑区域,这是朝着全面模拟啮齿类动物大脑迈出的重要一步。

“尽管在过去的一个世纪里进行了大量的研究,但只有4%的老鼠能够获得细胞数量——这些估计往往相差三倍之多,”蓝脑项目创始人和总监说,教授亨利·马克莱姆。“蓝色脑细胞图谱解决了这个问题,它提供了对老鼠大脑最小已知区域的最佳估计。”

“了解电路元件及其排列方式也是模拟大脑的基本出发点例如,对于建立一个国家的模型是必不可少的,”《细胞图谱》的主要作者和创造者解释说,Csaba Ero

以前的脑地图集由染色的脑切片图像组成。一些显示了整个大脑的精确细胞位置,而另一些显示了特定的细胞类型——但没有一个将这些有价值的数据转化为所有细胞的数字和位置在大脑中以数字导航地图集的形式存在。

这一革命性的步骤花了5年时间仔细收集和整合数千种脑组织染色。Erö和同事们主要依靠艾伦脑科学研究所提供的所有成像数据,并将这些数据与大量其他解剖研究相结合,计算和验证主要的类型、数字、以及老鼠大脑每个区域的细胞位置——包括所有以前从未获得细胞数据的区域。

“我们的细胞图谱就像是从手绘地图变成了城市和地理特征的数字化卫星图像——让我们能够像地球一样导航我们的大脑,”蓝脑部门经理Marc-Oliver Gewaltig说。“这是3 d的它是可搜索的、可导航的、有注释的、对用户友好的——它填补了我们对老鼠大脑96%区域的巨大知识空白。”

Blue Brain Cell Atlas可以在线免费获得,用户可以可视化所有737个大脑区域及其包含的细胞,并下载该区域及其编号和位置。它区分了兴奋性、抑制性和其他一些类型的神经元,以及被称为胶质细胞的主要非神经元细胞类型,胶质细胞隔离和保护神经元。这些数据对于研究人员试图了解不同大脑区域的结构和功能或建立特定大脑区域的功能模型非常重要。

Gewaltig补充说:“这也是一个很好的教学工具:你可以选择只显示感兴趣的区域,并通过这些区域导航到单个细胞的规模,这些细胞是由其形态类型的颜色编码的。”

蓝色脑细胞图谱也是第一个动态的大脑图谱——允许研究人员用任何新数据对图谱做出贡献和改进。“我们现在可以共同努力,去探索地球内部的真相”,马克莱姆解释说。

“我们的消息到处都是研究人员:尝试它,使用它,添加数据,”作者总结道。


进一步探索

艾伦脑科学研究所数据库发布的小鼠脑细胞数据几乎翻倍

更多信息:Csaba Erö等人,小鼠大脑细胞图谱,Neuroinformatics前沿(2018)。DOI: 10.3389 / fninf.2018.00084
所提供的前沿
引用: Blue Brain Project发布了第一个数字3d脑细胞图谱(2018年11月28日),并于2021年4月27日从//www.puressens.com/news/2018-11-blue-brain-first-ever-digital-d.html获得
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