研究人员使用优化的单细胞多OMICS测序来更好地理解结肠癌肿瘤异质性

中国多家机构的研究人员发现，使用优化的单细胞多组学测序可以更好地揭示结肠癌肿瘤的异质性。他们的论文发表在杂志上科学，该小组描述了他们了解结直肠癌进展的独特方法。

研究人员注意到，结直肠癌进展的大多数遗传研究涉及看基因表达。他们表明需要更多的研究来了解结直肠肿瘤的转移。为此，他们开发了一种允许分析的测序方法复制数字变体同时甲基化和基因表达单个细胞- 方法将单细胞测序数据与来自染色体构象，表观遗传数据和肿瘤细胞的其他特征的信息组合。

这项工作是真正了解转移机制的长期努力的下一步，特别是在结直肠肿瘤。两年前，该团队发表了一份关于他们工作的报告，涉及他们开发的名为sc Trioseq的单细胞三重组学测序技术，他们通过该技术收集了信息基因表达，CpG位点的甲基化和来自25个细胞的拷贝数改变癌症患者。

在下一阶段，研究人员将细胞数量增加到1900个，并提高了检测方法的效率。该研究收集了12名患者的细胞样本，其中10名患者提供了原发和转移性数据并进行分析。利用这两种来源的细胞数据，研究人员可以进行分离和鉴定遗传谱系这是由每个病人的突变发展而来的。他们利用甲基化数据和拷贝数信息来识别这些谱系，从而跟踪它们从原发肿瘤细胞转移到转移细胞时所经历的进化变化。

该团队报告说，与其他谱系相比，甲基化在相同的遗传谱系内的细胞中一致 - 与其他谱系相比 - 它也不同于肿瘤旁边的非肿瘤细胞。他们还发现，六条染色体表现出比其他染色体更大的去甲基化，其中三种具有复发性染色体变化。它们通过表明单细胞多OMICS测序提供了最佳机会，了解更多有关肿瘤进展和癌症的传播。

---

---

©2018 S欧宝app网彩cience X Network