重新定义结直肠癌亚型

直肠癌（CRC）的长期信念，每年导致美国约有50,000人死亡，可分为不同的分子亚型。在最近在期刊发布的论文中基因组生物学，Cuny Sph副教授Levi Waldron和同事挑战了这一基本假设，并提出了对肿瘤进行评分的方法，可以帮助更好地区分患者，这些患者可能因其暴露，结果和最佳治疗而异。

在这项研究中，作者对来自18项已发表研究的3700多名患者的个体基因表达数据进行了重新处理和标准化，创造了此类规模最大的标准化、标准化研究数据库《儿童权利公约》转录组“到目前为止。作者首先试图验证广泛接受的CRC亚型，但发现没有证据支持这些或其他CRC“转录组”的离散亚型，或所有基因的组合表达模式。

然后作者提出了一种新的方法，使用这样的数据库来识别离散的亚型或连续的分数，以提供转录组的简化措施。他们用它来识别两个有效的分数，以更好地描述CRC转录组的连续性。这些亚型得分与先前建立的亚型一致，但比离散亚型更好地代表CRC的个体变异性。评分可以更好地预测肿瘤的位置、分期、分级和无病生存时间，并可以被理解为代表包括炎症和免疫活动在内的生物活性。

“这项工作重新审视了在癌症研究的许多领域广泛用于识别癌症亚型的方法，并表明这些方法可以识别瘤不需要进一步验证的子集，”Waldron说。但最令人兴奋的是工作是它提供了一种新的方式来利用公开的数据库，以了解转录组变异的主要模式，这种方式甚至是患者群体的广泛的异质性和技术伪影。我们建议得分系统的稳健性很清楚，难以争议。我期待着现在为其他癌症类型和现在提供的更大数据库应用这种方法，更好地了解不同的人民肿瘤如何相似，以及它们是如何不同的。“

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