随着研究人员改进白血病分类，更准确的白血病诊断有望实现

就像制图师完成地图一样，研究人员已经确定了最常见的儿童癌症的多种新亚型——这一研究可能会改善高风险患者的诊断和治疗。圣裘德儿童研究医院的科学家领导了这项研究，该研究今天在该杂志上作为提前在线出版物发表自然遗传学。

研究人员使用综合基因组分析，包括RNA测序，来定义b细胞的基因组景观急性淋巴细胞白血病在近2000名儿童和成人中发现了B-ALL。b型ALL是最常见的ALL，也是儿童中最常见的癌症。B-ALL仍然是儿童癌症死亡的主要原因。

研究人员确定了23种B-ALL亚型，包括8种新的亚型，具有不同的基因组和临床特征以及结果。亚型患病率通常随年龄而变化。现在超过90%的B-ALL病例可以按亚型分类，而几年前这一比例为70%。

“B-ALL具有显著的分子多样性，我们和其他人已经利用它来完善分类，并推动精确药物的发展，以改善B-ALL的治疗和结果，”通讯作者查尔斯·穆利根说，他是医学博士，也是圣裘德病理学系的成员。“精准医学的一部分是精确的分子诊断，这项研究为更多的患者提供了这一诊断。”

一种新的亚型定义变化

转录因子基因PAX5的改变定义了两种新的亚型，包括PAX5 P80R，作为由点突变引发的第一个淋巴细胞白血病。“虽然继发性突变是必要的，而且通常涉及激酶信号传导，但我们证明了这一点点突变会损害B淋巴样细胞的发育，并促进小鼠B- all的发育，”Mullighan说。

另一种PAX5亚型，PAX5改变，是由基因的不同改变来定义的，包括序列突变或与其他24个基因之一的重排。PAX5亚型加起来占了之前未分类的B-ALL病例的近10%。

新的亚型包括主要发生在成人中的高危B-ALL。它是由转录因子BCL2与MYC或BCL6重排而定义的。“这种亚型的诊断结果令人沮丧，”Mullighan说。“认识到这种亚型定义重排可能会为患者带来替代疗法。”相反，由DUX4基因重排定义的亚型与成人的良好预后相关，正如之前在儿童中观察到的那样。

追踪基因表达

该研究证明了RNA测序识别多种类型基因组改变的能力，强调了该技术在白血病诊断中的实用性，特别是在全基因组测序不可用时。这项研究中的例子包括染色体重排导致基因融合，基因表达配置文件和其他更改。

“通过这项研究，三分之二的先前未确定特征的B-ALL患者可以被分为不同的亚型，具有不同的遗传改变谱和临床特征，”共同第一作者，Mullighan实验室博士后Zhaohui Gu博士说。“这可能会大大加快为这些患者定制治疗方案的开发。

“我们还建立了一个强大的B-ALL分类管道，主要基于RNA测序数据，可以整合到ALL的临床诊断中，”Gu说。

“作为一名临床医生，这些描述B-ALL亚型多样性的数据将使我们能够改善个体患者的预后能力，最终，将导致新的靶向疗法的发展，这种疗法将更有效地治疗白血病，副作用更少。”梅奥诊所医学教授、白血病委员会主席、东部肿瘤学合作小组主席和美国放射学成像网络学会主席、该研究的共同作者Mark Litzow说。

揭示的其他亚型

其他新发现的亚型包括:

• NUTM1基因重排与不同的伴侣基因，研究人员认为可能容易治疗
• HLF基因重排到多个基因，包括TCF4以及之前认可的合作伙伴TCF3。
• 三种亚型共享与已建立的B-ALL亚型相似的基因表达模式。该分类表明，新的亚型，etv6 - runx1样，kmt2a样和znf384样，具有与它们命名的已建立亚型相似的风险概况和预后。
• 其他由序列突变驱动的亚型包括IKZF1 N159Y。St. Jude和儿童肿瘤小组TARGET倡议的先前工作表明，IKZF1 (Ikaros)突变是高危B-ALL的标志。