常见的病毒对疫苗发育的希望“不太容易发生”
UCL研究人员发现,先天性残疾先天性残疾的最常见原因,人巨细胞病毒(HCMV)易于易于突变,这是一个可以帮助发展成功疫苗的发现。
HCMV,DNA病毒和疱疹病毒类型,是世界上最常见和普遍的人类感染之一,影响成年人群的45%至100%,具体取决于年龄和地理区域。虽然一般无症状,但HCMV是孕妇,未经免疫系统弱化患者的担忧。然而,发展疫苗已被证明是难以捉摸的。
以前的全球研究表明,在单个单独的HCMV中有很高基因组(遗传)多样性,导致HCMV具有高突变率的理论。这种特征通常在RNA病毒中看到,这种艾滋病毒或丙型肝炎,这反过来使它们难以开发疫苗。
现在使用新的病毒基因组测序,在UCL开发的生物信息和建模工具,研究人员分析了免疫功能化患者血液样本,并且显示HCMV不超过其他DNA病毒突变。相反,常规发生的遗传不同HCMV菌株引起的混合感染导致个体内高基因组多样性的结果。
该研究由欧洲联盟资助,已发表于此国家科学院的诉讼程序。
Lead Author,Judith Breuer教授(UCL划分对感染和免疫)表示:“已声称HCMV与静态易患艾滋病毒和丙型肝炎病毒一样的易于易受易受的RNA病毒一样多样化,这导致了很多混乱在该领域。
“使用我们的新型基因组测序和生物信息学建模方法,我们已经表明,在一些临床样品中看到的显然高HCMV多样性不是由HCMV突变引起的,而是由于频繁的HCMV菌株频繁的共感染。
“我们的研究首次证实了HCMV突变率类似于其他DNA病毒,为疫苗的开发提供一些保证,与超凡植物RNA病毒不同,HCMV不太可能突变避免疫苗。”
新的UCL测序工具
Breuer教授的工作侧重于应用下一代深度基因组测序,帮助揭示新的病毒特征。
通过称为“靶向富集”的方法,Breuer实验室具有促进的全病原体基因组测序,以直接从临床材料产生高质量的整体病毒基因组,而无需病毒培养或聚合酶链反应(PCR)。她将这些方法结合在内的尖端生物信息学,包括新开发的纵向序列数据(HAROLD)的单倍型重建。
在UCL开发,Harold是一种新的计算工具,适用贝叶斯混合模型来重建每个人的基因组序列病毒存在于含有多种病毒的样品中。
“这个过程与分类几个困扰着困在一起的拼图,”布雷尔添加了。
“从混合感染重新构建单个基因组序列的新生物信息学方法将使我们识别在患者中驱动HCMV演化的因素,包括重组,提供精确的方法来管理感染。”
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