人类基因组中结构变异的彻底表征

人类的基因组因人而异。这些差异包括DNA序列中单个核苷酸的变化或“拼写错误”，但更多的差异来自于结构变异，包括DNA大片段的添加、删除和重排。最近的一项研究使用了多种先进技术，比以往任何时候都更深入地研究了三种家庭中存在的结构变异，以及它们的功能后果可能是什么。

在过去的十年里，基因组测序已经变得更快、更准确、更便宜。结果，越来越多的人类基因组被测序，而我们对这些序列对功能和疾病的实际意义的认识也在迅速增长。

还有清楚的是，我们学到的越多，我们就越多欣赏我们仍然了解人类基因组学。虽然ATGCS的线性序列看起来整洁，但我们的基因组实际上是具有相当大的差异之间的动态实体，其差异可以改变促进正常功能和疾病的特征。

这遗传差异人与人之间有助于我们的个性。这些差异包括数以百万计的单核苷酸变异——例如，一个人可能在某个位置有A，另一个人可能在某个位置有C。还有成千上万的结构变体(sv)。svv包括插入或删除的DNA片段基因组，复制的段和倒置的段。SVS比单一核苷酸变体更难以识别，因此它尚不清楚在给定的人类基因组中真正存在的SVS。

一篇名为“人类基因组单倍型结构变异的多平台发现”的论文发表在自然通信，比以往任何时候都更深入地研究个体基因组差异。

这项工作涉及来自人类基因组结构变异联盟（HGSVC）的大型研究人员，由Co-First作者Mark Chaisson，Ph.D.，Ashley Sanders，Ph.D.和Xuefang Zhao，Ph.D。他们使用全套基因组技术，以广泛地分析三个家庭三人（父母和儿童）的基因组。使用的技术包括长读，短读和股线特定的测序技术，光学映射和用于SV检测的多台计算机算法。结果在儿童基因组中显示了迄今为止的SV最全面的SV目录，包括在每个SV的各组染色体上存在的信息。

总之，研究人员平均鉴定了818,054个小的插入和缺失（每个基因组改变，每个受影响的DNA碱基）和每种基因组的27,622 svs（受影响50个碱基或更多DNA的基因组改变）。值得注意的是，每个基因组也发现平均156个倒置，其中许多与遗传疾病综合征相关的基因组区域相交。研究人员发现，常规测序技术和常用的计算机算法实际上错过了每个人以上100,000个变体。例如，标准的短读取算法错过了83％的插入识别。事实上，给定的SVS的真实数量人类基因组似乎是大多数研究通常确认的3到7倍。

因此，svv构成了目前不常见的大量遗传变异基因组测序技术和分析方法。这意味着SVS对人类疾病的贡献尚未得到良好量化，并且扩展的SV曲目可以帮助识别新的遗传关联，并改善未来遗传测试中的诊断产量。

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