全球对结直肠癌的微生物签名

癌症一直是已知出现由于环境因素如健康的饮食或吸烟。最近,微生物生活在和我们的身体已经进入了舞台上关键球员:胃癌可以由单一细菌物种,幽门螺旋菌,肠道微生物的作用发挥发展的全球第三大常见的癌症结肠直肠癌症元凶不明朗。确定他们的影响力,关联研究旨在地图如何殖民结直肠癌患者的肠道微生物不同于那些生活在健康受试者。

大学的研究人员从EMBL特兰托,他们的国际合作者已经分析了多个现有微生物组协会的研究结直肠癌症与新生成的数据。他们的荟萃分析建立针对疾病的微生物变化是全球robust-consistent七个国家在三个continents-despite环境的差异,各地的饮食和生活方式。

Georg西从海德堡欧洲分子生物学实验室(EMBL)德国:“我们使用了严格的机器学习分析识别微生物结直肠癌的签名。我们在早期癌症阶段验证这些签名,在多个研究,所以他们可以作为未来的非侵入性的癌症筛查的基础。”

大学的Nicola Segata特兰托在意大利:“我们不仅建立了肠道的面板微生物在人口与结直肠癌相关,但也发现签名在微生物新陈代谢,有类似的预测能力。这将使新研究旨在了解肠道微生物可能会对癌症发展。”

EMBL的科学家领导的研究集中在转变过程中,某些肠道细菌胆汁酸是我们消化液的一部分到代谢物,可以致癌。特兰托大学的相关研究表明,某些种类的细菌降解胆碱,肉类和其他食物中包含的必不可少的营养,并将其转化为一个潜在的危险的代谢物。这种代谢物曾增加心血管疾病的风险,也可以与结直肠癌。

宏基因组研究的一个挑战,是基于遗传物质从微生物等环境样品的凳子上,是将基因片段的各种微生物生物他们属于。这个所谓的目标分类分析的任务是确定和量化细菌物种存在于样本。“尽管不同的方法在分类分析和统计分析,我们研究了非常相似的结论,”博克EMBL组长同行说,“这使得这个microbiome-based最有前途的病例的诊断。”

提供一个完整的metagenome的照片

EMBL的团队在他们的研究中,采用一种新颖的工具叫mOTUs2能够非常准确地识别和计数细菌物种基因组。这个工具是与从苏黎世ETH Sunagawa组。“我们的方法最强大的特性是它使我们能够量化的细菌基因组参考,甚至没有“Georg泽勒说。“这些物种没有孤立和培育的然而许多他们不能很容易地生长在实验室。但是,随着运动,我们可以捕捉他们无论如何,导致微生物的一个更完整的画卷。”

调节肠道菌群?

西:“因为我们的研究结果与最近由其他研究人员显示的新方法,微生物可能导致癌症的发展,他们提出的问题如何调节肠道菌群,例如通过阻止某些物种殖民我们的肠道。但这是非常困难的!”

同行博克领导的研究人员最近发现,可能会使我们更接近这一目标。在今年早些时候发表的一项研究中,他们发现,有许多共同的微生物菌株在唾液和粪便样本。这表明细菌的传播从嘴到肠道是很常见的,这造成的障碍胃酸比先前认为的要弱。“oral-gut传输也有趣,因为它可以提供可能性采取行动反对或赞成某些株细菌,”博克说。“然而,重要的是要意识到我们是如何知道我们的肠道微生物组。我们现在可以认识到结肠直肠癌的微生物,但是我们不知道这些微生物是从哪里来的,他们如何函数,或健康的微生物是什么样子。因此,仍有很多工作要做。”

这项研究报告自然医学今天。

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