研究人员开发工具来估算细胞系的遗传多样性和祖先
癌症是一种高度不同的疾病,具有不同肿瘤类型,个体和祖先人群的遗传差异。这些遗传差异会影响疾病的侵袭性,疾病类型和对治疗的反应。重要的是,科学家们有适当的工具和模型系统,以研究这些变异如何影响癌症的发展,并为所有遗传背景的患者设计有效的疗法。在发表的新文件中癌症研究Moffitt癌症中心研究人员与Rico Ponce健康科学大学的科学家合作,通过创建一个可以被科学家使用的在线工具来确定超过1300种不同的细胞系的遗传祖先起源来调查了这个问题。
在癌症研究中,细胞系从患者肿瘤中建立用于实验室实验,作为模型系统,以了解癌症的分子和细胞基础,鉴定治疗靶标并发展新的治疗方法。然而,这些细胞系的遗传血统通常是未知的或不完整的。因此,科学数据可能无法准确反映全世界存在的各种人群,导致对不同群体的患者管理和治疗较少。
研究团队通过检查1,393的遗传血统来进行广泛的分析来改善这种知识差距癌细胞系基于已知人群。他们发现这些常用的细胞系不代表人口的各种血统。大多数62.46%的细胞系决定是来自欧洲来源的,而29.18%来自东亚来源。所有其他群体均以不到10%的分析细胞系代表,其中包括5.26%的非洲原产地,非洲裔美国人的0.86%,占西班牙裔/拉丁裔的1.95%。此外,许多人祖传人对于特异性癌症类型的细胞系中,在很大程度上缺席或不足。例如,已知非洲裔美国人被诊断出来前列腺癌在较年轻的年龄,患有疾病的风险更高,而不是其他人群。然而,发现10个前列腺癌细胞系中只有1种表示非洲祖先的遗传因素。
通过他们获得的信息,团队创建了一个在线,互动网络的工具,允许研究人员确定细胞系的遗传血统。“这些信息可以由科学家作为数据和可视化工具来显示他们正在使用的细胞系的遗传血统,”史蒂文·埃斯克里希,博士说,博士学位,斯蒂文·埃斯克里希(Steven Eschrich),Ph.D.,博士学位,博士学位,博士学位,博士学位,博士学位,博士学位,博士学位,博士学位,史蒂文·埃斯科希说,博士学位,博士学位,史蒂文·埃斯科希说,博士学位,博士学位,博士学位,史蒂文·埃斯克里希(Steven Eschrich)表示,“生物统计数据的资格和高级成员和Moffitt的生物信息学部门。“我们认为,这一新工具代表多样化的祖先将是减少疾病预防和各种祖传人群中存在的知识间隙的重要资源。”
“我们希望这一资源允许研究人员在细胞系模型中获得祖先,并有助于以明确的差异解决癌症类型的癌症特性的努力。将估计的遗传祖先纳入细胞系中分子生物学药物发现研究可以显着提高严格,再现性和相关性癌症研究活动,不仅仅是那些明确审查遗传血统在癌症生物学中的作用的人,“庞塞卫生科学大学教授Julie Dutil说。
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