一万名癌症患者的P53突变让人们对基因功能有了新的认识
TP53是研究最广泛的癌症基因之一,以其肿瘤抑制作用而闻名。它能感知到细胞的压力或损伤,并相应地阻止细胞分裂或启动细胞死亡,从而阻止受损细胞的繁殖。这种基因的突变消除了一个关键的细胞故障安全机制,是导致癌症的一步。贝勒医学院的研究人员对TP53突变进行了最全面的研究,以更好地了解导致这一重要基因失活的过程。他们的研究结果发表在杂志上细胞的报道该研究揭示了基因是如何发生突变的,以及这些突变如何有助于预测临床前景。
贝勒医学院(Baylor College of Medicine)分子病毒学和微生物学教授拉里·唐纳豪尔(Larry Donehower)博士领导的研究小组研究了来自32种不同癌症的10225例患者样本,这些样本来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas),并将它们与另外8万例进行了比较突变Sorbonne大学分子生物学教授Thierry Soussi博士收集了30多年的数据库。在分析了这个大的数据样本后,他们对TP53基因突变如何影响癌症有了更深入的了解。
研究小组发现,在所有研究的癌症类型中,TP53突变在生存率较低的患者中更为频繁。但他们也找到了一种更准确预测预后的方法。唐纳豪尔表示,他确定了四项上调基因突变型TP53肿瘤中,其表达与患者预后相关。
“如果这四种基因的高表达,你的病人就更有可能有不良的预后,”贝勒丹·L·邓肯癌症中心(Dan L Duncan Cancer Center at Baylor)的成员Donehower说。“相反,如果患者的这些基因表达量很低,他可能会活得更久,预后也更好。这比只知道他是否是TP53突变体更能让你了解他的病情。”
在染色体水平上,研究小组发现了TP53基因丢失的明显模式。
“在一些癌症基因中,你会看到两个基因的一个副本丢失或突变,”Donehower说。“超过91%的癌症失去了两个TP53基因,而不是一个。”
第二种基因丢失是由于突变、染色体缺失或基因重复造成的。根据Donehower的说法,基因复制的发生率比之前认为的要高得多。
该研究还表明,TP53突变与基因组不稳定性密切相关,表明正常蛋白质在监测染色体完整性方面的作用。在大多数TP53突变肿瘤中,其他肿瘤抑制基因基因被删除,而导致癌症发展的致癌基因被扩增。
虽然已经有很多关于TP53的研究,但这是第一次使用五种不同的数据收集方法来检测如此多的肿瘤和癌症类型。Donehower说,这项研究的规模使他的团队能够注意到在小样本中可能不明显的模式和相关性。
Donehower说:“大多数关于TP53的研究都专注于一种癌症类型。”“看32种不同的癌症你会发现,无论哪种癌症,某些模式都是成立的。”
该研究的作者、贝勒医学院莱斯特和苏·史密斯乳房中心癌症基因组学主任大卫·惠勒博士说,这项研究的结果可能为治疗这种基因缺失导致的癌症的新方法打开了大门。
“由于TP53是癌症预防中最重要的把关人之一,我们对这个基因了解得越透彻,我们就越能理解癌症的基本生物学癌症.这将带来更好的治疗方法,”惠勒说,他是贝勒人类基因组测序中心和丹·L·邓肯综合癌症中心的成员。
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