研究人员开发方法对于识别咄咄逼人的乳腺癌的司机
精密癌症医学需要个性化的生物标志物识别患者将受益于特定的癌症疗法。为了提高预测的准确性对乳腺癌患者预后和个性化治疗的疗效,北卡罗莱纳大学Lineberger综合癌症中心的研究人员已经开发出一种方法来准确识别个人积极的乳腺癌病人。
这种新方法包括分类和描述入侵乳腺癌细胞的表观遗传一品质的方法,包括分析特定监管蛋白质与DNA相互作用如何控制他们的表达以及如何放大或异常表达的基因。研究人员发表在《细胞出版社期刊iScience他们使用这种技术来识别潜在的新预测预后标记不同的两个主要亚型的临床结果乳房癌症。
“这篇论文描述了一个突破性的multi-omics技术发现司机的增殖和侵袭性乳腺癌肿瘤,”说,UNC Lineberger西安Chen博士,教授北卡罗来纳大学医学院生物化学与生物物理学。“我们认为,最终,这些工具可以帮助医生更好地预测特定的病人有很好的响应,或获得抵抗治疗。”
医生往往依赖于肿瘤大小的信息,癌症已经扩散和肿瘤亚型是否作出治疗决定。除了临床亚型乳腺癌分子亚型的研究人员发现,被用来帮助治疗决策。然而,陈认为现有标记不足以区分乳腺癌患者亚种群具有不同的临床结果。
“单一的“组学”的方法,这依赖于基因组学,转录组,或蛋白质组学,不解剖的异质性导致个体病人的可变性的肿瘤生长、转移,或对抗癌治疗,”他说。“因为生物标记不是可用来区分不同的患者群体反应或对特定的药物,医生没有他们需要的所有工具预测病人对治疗的反应和结果。”
在他们的研究中,研究者想看看他们可以分层患者超越现有的分子亚型。他们的目标是开发一种方法,以确定哪些患者在一个亚型中会产生耐药性或侵入性癌症。有五个主要分子亚型乳腺癌的分类根据肿瘤的基因表达。
陈和他的同事们分析了腔的乳腺癌和乳腺癌官腔,也就是俗称三阴性乳腺癌,使用乳腺癌样本两个大型国际研究,癌症基因组图谱和乳腺癌的分子分类学国际财团。
超越亚型鉴别哪些患者可能会产生耐药性,他们第一次排序最侵入性肿瘤细胞在冷冻组织使用分子探针,能够区分肿瘤与邻近良性细胞或组织通过绑定到一个后生监管机构或组蛋白甲基化酶,称为G9a。这种酶已被其他科学家报道异常调节在许多癌症类型,包括乳腺癌。
然后确定选择G9a蛋白质,与作为犯罪团伙,并向后从那里来识别基因异常与这些合作伙伴在癌细胞蛋白质。他们发现在许多情况下这些关联的基因蛋白质被放大在多个副本,或不正常的过表达,而不是突变。
“如今,人们认为选择基因的体细胞突变是肿瘤发生的主要驱动因素,”陈说。“我们没有看到许多基因突变在我们确认司机。我们发现基因编码扶少团团员有高频放大在乳腺癌患者预后差。”
然后他们使用这些信息来生成的基因蛋白质编码这些“关联”,识别那些与患者的不良预后有关。展望未来,陈和他的同事计划确定multi-omic畸变的特异性和敏感性的特定关联基因集作为新的生物标记物预测系统癌症病人的预后。
