全基因组测序的产前诊断

全基因组测序的产前诊断
全基因组测序的吞吐量高达48个样品每运行。信贷:香港中文大学(中大)

美国妇产科医学院的香港中文大学(中大)已经成功地引入了一个新基因组测序技术侵入性产前基因诊断。它提供了增强的诊断的敏感性和准确性致命和严重的先天性障碍通过精确检测致病性microdeletion或microduplication胎儿,而当前的实践分析和染色体核型分析微阵列分析(被称为胎儿DNA芯片测试)。创新团队进行了一项研究,发现最近在《华尔街日报》发表的医学遗传学

遗传提供更精确的分析和检测更小的基因异常在怀孕期间

孕妇经历了流产或死胎,或揭示了超声检查胎儿异常或唐氏综合症筛查阳性结果,建议接受进一步侵入性产前诊断胎儿的遗传疾病。

传统的胎儿染色体核型分析研究的结构。大约三分之二的这些胎儿正常核型结果,但至少有10%的人将结构异常,这是相关的一系列症候群的疾病和遗传性疾病。

Tak Yeung梁教授,妇产科学系主席在中大医学院解释说,“如果一个临床显著遗传不平衡是诊断胎儿,它将允许母亲和家庭做出明智的决定,帮助怀孕的管理和未来。使特定的这些综合征和遗传疾病产前诊断是困难的,因为很多都是与亚微观的染色体异常所察觉的常规核型分析。”

中大在2009年成为第一个在香港和亚洲太平洋地区引入胎儿DNA芯片测试,使用染色体微阵列分析诊断100多万个常见micro-deletion或重复症状不会检测到核型分析。今年,妇产科团队介绍提供一个更全面和精确的检测方法micro-deletions或重复。

全基因组测序识别额外的和临床相关的基因和染色体异常与胎儿DNA芯片测试

全基因组测序的产前诊断
美国妇产科医学院的香港中文大学(中大)已经成功地引入了一个新基因组测序技术侵入性产前基因诊断,提供一个更精确的检测胎儿的病原体。(右)副教授理查德教授邝围白菜,系主任Tak Yeung梁教授和研究助理教授猫王Zirui董博士的妇产科,在中大医学院。信贷:香港中文大学(中大)

胎儿DNA芯片检测和全基因组测序(WGS)检测胎儿遗传不平衡或个人通过检查染色体拷贝数变异(CNVs),使用绒毛膜绒毛取样细胞羊膜液体或胎儿脐带血。基因拷贝数异变是一个特定基因的拷贝数或部分基因组的重复或错过使变化从一个人到另一个。这导致人与人之间的特殊性和解释一些人类疾病。

教授理查德·邝围白菜,妇产科学系的副教授,在中大医学院说:“胎儿DNA芯片测试允许快速和深入分析染色体的一个测试。然而,CNV分析胎儿DNA芯片测试是高度依赖的探针密度目标区域。WGS是一种最先进的新一代测序的方法提供全基因组序列信息。然而,WGS read-depth高是昂贵的,而它也检测到大量的变异不确定的意义。在过去五年里,我们的团队已经发展和优化的全基因组拷贝数变异分析利用低通WGS与内部分析管道命名FetalSeq它已经证明了鲁棒性检测基因拷贝数异变在更高的分辨率和为产前诊断提供了额外的和细胞遗传学的相关信息相比,胎儿DNA芯片测试。吞吐量高达48个样品每运行。”

评估的准确性、有效性和增量收益率FetalSeq与胎儿DNA芯片检测相比,中大团队在1023年进行了一项前瞻性连续比较产前妇女被入侵。受试者参与研究的2016年底和2019年初之间通过两个产前诊断中心在中大和暨南大学。

结果表明FetalSeq能够检测所有基因畸变被胎儿DNA芯片测试,此外,提供了额外的1.7%(17/1,023)病例的诊断信息。后续研究证实了这些额外的基因拷贝数异变的致病性FetalSeq探测到。

猫王Zirui董博士的妇产科学系研究助理教授中大医学院的说:“全基因组解析,FetalSeq显示了潜在的优势确定遗传病因在人类疾病归因于染色体疾病,致病基因拷贝数异变或单基因疾病如杜氏肌萎缩症。这项技术提供了更精确的预后信息和他们的家庭的进一步管理。”

中大妇产科团队先锋产前基因诊断

美国医学院的妇产科中大的领导人在香港产前基因诊断。问世以来的胎儿DNA芯片检测识别数字障碍(即。唐氏综合症)和microdeletion或重复综合症在2009年,美国一直服务大幅增加对外来基因检测的需求。2019年6月,医院管理局开始提供胎儿DNA芯片测试所有香港与高危妊娠孕妇免费的。

中大最近的一项研究在临床上重要的光谱基因拷贝数异变在产前诊断胎儿DNA测试证明,致病基因畸变发生1 64年怀孕接受侵入性测试。


进一步探索

使用胎儿基因测序增加基因发现的检出率

期刊信息: 医学遗传学

引用产前诊断:全基因组测序(2019年9月18日)检索2022年10月5日从//www.puressens.com/news/2019-09-genome-sequencing-prenatal-diagnosis.html
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