研究人员开发用于将组织类型分离肿瘤样品中的方法

一个致密的组织网可以包围胰腺癌肿瘤，阻碍治疗，有时作为一个屏障，以防止肿瘤的扩散。研究人员希望将癌变组织与周围的结缔组织和基质细胞以及肿瘤环境中的免疫细胞区分开来，以便制定个性化的治疗策略。

在杂志中自然通信来自北卡罗莱纳大学莱恩伯格综合癌症中心的研究人员报告说，他们已经设计了一种计算方法来分离特定样本中的不同组织——无论是胰腺癌中的基质，免疫细胞或癌症细胞。

“我们开发了一种方法，通过解构肿瘤的基因组数据来确定是什么细胞单元构成了一个肿瘤，”北卡罗来纳大学医学院的药理学和外科教授、外科学系研究副主任Jen Jen Yeh医学博士说。“这可以帮助分离出免疫、肿瘤和基质微环境，这样我们就可以更好地了解每一种微环境的生物学特性，从而帮助研究临床重要的改变。”

研究人员描述了它们的分离方法组织在一个样本中，他们称之为DECODER。利用来自癌症基因组图谱的多个癌症组织样本，他们证明DECODER可以区分不同肿瘤的共同信号。此外，他们使用DECODER解构了最常见的胰腺癌类型——胰腺导管腺癌的样本，使他们能够看到来自免疫、肿瘤或间质的隔间的信号。

最终，研究人员的目标是分离组织，以便进一步了解患者肿瘤的独特生物学特性，以及肿瘤周围的组织。

在以前的工作中，YEH和她的同事发现，肿瘤周围的环境的组成与治疗反应和患者结果相关联。在发表的一项研究中自然遗传学2015年，研究人员分析了如何在肿瘤和基质中表达基因，发现有两种类型的肿瘤和两种类型的基质。

他们设想了对解码器的多个额外应用，包括在其他肿瘤中施加组织分离方法，以帮助了解癌症和癌症的微环境。他们还计划研究解码器是否可以帮助他们识别具有一个患者的癌症瘤来历不明的。

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