离精准治疗癌症又近了一步

来自赫尔辛基大学医学院和分子医学研究所(FIMM)的研究人员开发了一个计算模型，结合必要评分(CES)，能够准确识别癌细胞中的必要基因，用于开发抗癌药物。

为什么必需基因对癌症很重要?

癌症是全世界最主要的死亡原因。癌细胞通常在某些基因激活的情况下生长得更快。靶向治疗的目的是抑制这些只在体内激活的基因癌症细胞，从而最大限度地减少对正常细胞的副作用。

为了评估单个基因对癌细胞生存的重要性，已经建立了高通量遗传筛选。这样一种方法可以让研究人员确定所谓的基因重要性分数，几乎所有的基因跨越大量不同的癌细胞系。

然而，对估计的基因重要性的可复制性的挑战阻碍了它用于药物靶标的发现。

shRNA和CRISPR-Cas9是两种用于进行高通量遗传筛选的常用技术。尽管改善质量控制研究的第一作者王文宇解释说:“这两种技术在同一癌细胞系上的基因重要性得分是不同的。”

我们怎样才能做得更好?

为了协调基因筛选数据，研究人员提出了一种新的计算方法，称为联合必要度评分(CES)，利用shRNA和CRISPR-Cas9筛选的信息加上癌细胞的分子特征来预测癌症必要基因。该研究小组证明，CES能够比现有的计算方法更准确地检测关键基因。此外，研究小组还展示了两个预测结果至关重要的基因确实与预后不良分别用于乳腺癌和白血病患者，表明它们具有作为药物靶点的潜力(图1)。

“提高基因重要性评分只是一个开始。我们的下一个目标是通过整合药物敏感性和基因必需性图谱来预测药物-靶标相互作用。考虑到功能筛选数据集的不断增长，我们希望扩展我们对药物靶标的知识，这将最终有利于个性化药物的发现，”研究的通讯作者，助理教授Jing Tang说。

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