新数据库增强基因组学研究协作
共享数据集显示澳大利亚和北美研究人员开发的一个新的开源数据库，揭示了健康和疾病中基因组变异的功能。
MavedB数据库是来自Valiant Effect（Maves）的实验多重测定的数据的数据库 - 系统地测量成千上万个体序列变体对基因的函数的影响。这些实验可以提供有关如何通过该基因功能产生的蛋白质的有价值的信息，该基因的变种可能有助于疾病，以及如何将天然存在的蛋白质的合成版本更加有效，这些蛋白质比原始蛋白更有效。
MavedB是此数据的第一个公开访问的数据库。澳大利亚沃尔特和伊丽莎霍尔研究所的艾伦·鲁宾博士，澳大利亚副教授，副教授来自华盛顿大学，美国，从加拿大多伦多大学的弗雷德里克·罗斯教授，澳大利亚·沃尔特和伊丽莎霍尔研究所副教授。Mavedb今天在期刊中描述了基因组生物学。
增强基因组学研究
Maves彻底改变了研究人员了解功能的能力基因博士博士说，他们在疾病中的角色说。
“在过去，研究人员必须专注于基因的少量变化以了解其功能，”他说。“它太复杂，无法从一定数百或数千个基础的基因的穷举扫描中生成数据。
“米瓦的发展为研究人员提供了一种方法，用于通过其功能后果进行实验测量基因中的每一种遗传变化。这些测定可以处理成千上万的遗传变异，允许研究人员在相关变化中回家并将它们放在上下文中并将它们放在上下文中。“
到目前为止，来自实验的Mave数据是孤立存在的，其中各个研究中的数据上传到期刊网站调查报告已发布，或根据要求提供给其他研究人员。
“这使得研究人员难以访问其他群体的数据，甚至知道特定的麦波林博士说，这可能阻碍了合作和基因组学研究的进展。”
“Mavedb使科学家更容易使用适用于多个研究领域的灵活格式在一个位置中分享他们的数据集，并使其他科学家能够轻松访问此数据以增强他们的研究。我们还确保了Mavedb可以谈论“到其他数据库，以增加额外的协作能力。对于Mave Research的越来越多的领域，该数据库是通过确保数据提供的开放科学和再现性的重要一步。”
从Maves获得的数据具有许多应用，包括了解基因或蛋白质的功能，测量遗传变异在疾病中的累积，或理解合成蛋白质 - 例如生物技术中使用的蛋白质 - 可以更有效。
可视化数据
除了建立Mavedb，该团队还开发了数据可视化软件，称为MAVEVIS，这使得研究人员更容易理解和解释MAVE实验的结果。
“MaveVIS为MAVE数据提供了立即和一致的显示器，包括蛋白质结构信息等有价值的注释，这将加速协作研究，”Rubin博士说。
“我们设想，随着MavedB在生物信息学社区中更广泛地使用，将添加其他应用程序，以便可视化和解释复杂的基因组学数据的新方法 - 导致增强生物医学研究的新发现。这可能是新药物的发展，ob欧宝直播nba或者了解患者的基因组变异如何为疾病有助于造成疾病。“
进一步探索
用户评论