致癌的罪魁祸首将被他们的DNA指纹
癌症的原因被一个巨大的国际编目研究揭示的遗传指纹能损伤dna的过程驱动癌症发展。威康桑格研究所的研究人员,Duke-NUS医学院新加坡、加州大学圣地亚哥医学院麻省理工和哈佛大学和他们的合作者在世界各地取得了迄今为止最详细的列表,这些遗传指纹,为每个癌症如何发展提供线索。
这些指纹将使科学家们寻找未知的化学物质,生物致癌途径和环境代理负责。
这项研究发表在自然今天作为一个全球Pan-Cancer项目的一部分,将有助于理解癌症的原因,通知预防战略,帮助路标为癌症诊断和治疗的新方向。
也发表在自然和相关期刊,从Pan-Cancer 22进一步的研究项目。协作,涉及1300多名科学家和临床医生来自37个国家,超过2600的基因组分析38个不同肿瘤类型。项目代表了一个前所未有的国际癌症基因组的探索,极大地提高了我们的基本的理解癌症和会瞄准癌症发展的机制。
在英国,每两分钟,有人被诊断为癌症,每年有363000新癌症病例。这种疾病在英国每年造成约165000人。
癌症是由基因引起的changes-mutations-in细胞的DNA,使细胞分裂失控。许多已知的导致的癌症,如紫外线和吸烟,离开特定的损害DNA指纹,称为突变签名。这些指纹可以帮助了解癌症发展,并有可能,他们是可以预防的。然而,过去的研究并未大到足以识别所有潜在的突变特征。
指纹研究发现没有见过的新突变特征,从单一的信中“错误”突变,基因编码的略大的插入和删除。结果是最大的数据库引用突变特征。只有大约一半的所有突变签名已经知道原因,不过这个资源可以用来帮助找到更多这样的原因和更好的理解癌症的发展。
迈克·斯垂顿教授研究的资深作者,康桑格研究所的主任,说:“用我们的详细目录范围的癌症DNA突变签名,全世界的研究人员现在可以研究化学物质或过程都与这些签名。这将增加我们了解癌症的发展,和发现新的癌症的原因,帮助通知公共卫生策略来预防癌症。”
博士Ludmil Alexandrov,这项研究的第一作者从加州大学圣地亚哥说:“我们发现几乎每一个公开可用的癌症基因组在这个项目的开始和分析他们的全基因组序列。从这些成千上万的癌症数据让我们比以往更详细地描述突变签名,我们有信心,我们现在知道的大部分签名存在。”
教授史蒂文•Rozen Duke-NUS医学院的资深作者,新加坡,说:“某些类型的这些DNA指纹,或突变特征,反映癌症可能如何应对药物。进一步研究这可能有助于诊断癌症和一些药物可能回应。”
迦得盖茨教授资深作者从麻省理工和哈佛,麻省总医院,说,“整个基因组的大量的可用性使我们更先进的分析方法应用于发现和提炼突变签名和我们的研究扩展到其他类型的突变。我们的新收集的签名提供了一个更完整的图片损坏或修复DNA的生物和化学过程,将使研究人员能够破译新测序的基因组的突变过程影响癌症。”
Pan-Cancer的另一个研究项目,发表在自然今天,发现更大、更复杂的基因变化,重新排列DNA也可以充当突变签名,并指向原因的癌症。威康基金会桑格研究所的研究人员麻省理工和哈佛大学和他们的合作者发现16这些签名,跨越了从单个基因重组整个染色体。
全球Pan-Cancer项目是整个癌症基因组的最大和最全面的研究。的合作创造了一个巨大的资源主要癌症基因组,研究人员在世界范围内促进癌症研究。
彼得•坎贝尔博士Pan-Cancer指导委员会成员、癌症、衰老和威康基金会桑格研究所的体细胞突变说:“整个Pan-Cancer工作是帮助解决一个长期存在的医疗困难:为什么两个看似相同的癌症患者可以对同一药物的反应不同。我们表明,治疗这些不同影响的原因都写在DNA。的基因组每个病人的癌症是独特的,但有一组有限的循环模式的DNA,所以与足够大的研究我们可以识别这些模式来优化癌症诊断和治疗。”
进一步探索
仪陇,尼古拉·D·罗伯茨,耶利米Wala & Ofer Shapira et al。(2020)的体细胞在人类癌症基因组结构变异模式。自然。DOI: 10.1038 / s41586 - 019 - 1913 - 9,www.nature.com/articles/s41586 - 019 - 1913 - 9
整个基因组的ICGC / TCGA Pan-Cancer分析财团。(2020)Pan-cancer整个基因组的分析。自然。DOI: 10.1038 / s41586 - 020 - 1969 - 6,www.nature.com/articles/s41586 - 020 - 1969 - 6
的自然收集的着陆页的PanCancer出版物将论文发表时上线:www.nature.com/collections/pcawg/