迄今为止,前所未有的探索产生最全面的癌症基因组地图
![Credit: CC0 Public Domain 癌症](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2020/cancer.jpg)
国际团队迄今为止已经完成了对全癌基因组的最全面的研究,显着提高了对癌症的根本理解,并为其诊断和治疗方向进行了新的方向。
ICGC / TCGA泛癌全部基因组项目(PCAWG)(PCAWG)称为泛癌项目,涉及来自37个国家的1,300名科学家和临床医生的合作,分析了38种不同肿瘤类型的2,600多种基因组,创造了一个巨大资源癌症基因组。这是16个工作组的发射点,研究癌症的发展,因果关系,进展和分类的多个方面。
以前的研究侧重于蛋白质代码的基因组的1%,类似于绘制大陆的沿海。泛癌项目探讨的剩余99%的基因组探讨,包括控制切换基因的关键区域,这些区域被控制和脱离类似于绘制大陆的内部与其海岸线。
泛癌项目已经提供了癌症基因组学研究的综合资源,包括原始基因组测序数据,癌症基因组分析的软件,以及多个互动网站探索泛癌项目数据的各个方面。
泛癌项目扩展和先进的方法,用于分析包括云计算的癌症基因组,并通过将这些方法应用于其大型数据集,发现新知识关于癌症生物学并确认了以前研究的重要结果。在今天出版的23篇论文中,泛癌项目报告说:
- 这癌症基因组是有限且知识的,但非常复杂。通过将整个癌症基因组的测序与一套分析工具相结合,我们可以表征癌症中发现的每种遗传变化,所有生成这些突变的过程,甚至在癌症的生命历史中均关键事件的顺序。
- 研究人员是接近目录癌症所涉及的所有生物途径并在基因组中拥有更全面的行动。在分析的所有癌症几乎发现了至少一种原因突变,并且发现产生突变的过程是从单一DNA字母的重组到整个染色体的重组中的更加多样化的变化。基因组的多个新颖区域控制基因如何接通和断开如何被鉴定为癌症突变的靶标。
- 通过一种新的“碳约会”方法,泛癌研究人员发现,在肿瘤出现之前,可以识别发生年份,有时甚至数十年的突变。理论上,这将在理论上打开,早期癌症检测的机会窗口。
- 可以根据遗传变化的模式准确地识别肿瘤类型在整个基因组中看到,潜在地帮助患者癌症的诊断,其中常规临床测试无法识别其类型。知识确切的肿瘤类型也可以帮助定制治疗方法。
“我们与世界各界的调查结果是探讨了整个癌症基因组无与伦比的十年合作的高潮,”在安大略省研究所的项目指导委员会和适应性肿瘤主管部门林肯斯坦博士说用于癌症研究(OICR)。“随着我们对肿瘤的起源和演变获得的知识,我们可以开发早些时候发现癌症的新工具,更加成功地开发更具针对性的疗法和治疗患者。”
“这项工作有助于回答长期的医学困难,为什么两个患者似乎是同一癌症的患者可以对同一药物治疗具有截然不同的结果。我们表明这些不同行为的原因是用DNA写入的原因。每个患者癌症的基因组是独一无二的,但是有一个有限的重复性模式,因此有足够大的研究,我们可以识别所有这些模式以优化诊断和治疗。“Peter Campbell博士说,泛癌项目指导委员会和癌症,老龄化和英国Wellcome Sanger Institute的癌症,老龄化和躯体变异负责人。
“本研究向基因组的所有部分中的癌症导致突变日期提供了最完整的图。这是一个涉及跨越全球的研究人员的大规模团队科学努力,”指导委员会成员杰什斯图尔特博士,生物分子工程教授Josh Stuart在UC Santa Cruz。“在UC Santa Cruz,我们在系统生物学和RNA表达中的优势有助于我们在先前未开发的非探索的非分量基因组中与导致癌症的途径连接的结果。如图所示,这项新作品创造了研究人员可以使用的参考和资源解释未来的数据和医生可以用来指导治疗。“
“随着在全球患者越来越多的患者中,在越来越多的患者中持续下降和基因组数据的积累,本项目中所表演的综合分析将作为未来工作的模板,并将在癌症中实现新的发现,”博士指导委员会成员说。马萨诸塞州综合医院和广泛的麻省理工学院和哈佛大学病理学教授Gad Getz。
“这一巨大的国际学习才是由于世界各地的一千多名研究人员和临床医生的工作和合作,才能感谢所有参与的人,”指导委员会成员Jan Korbel博士从欧洲分子生物学实验室(embl)在德国海德堡。
“这个项目的完成代表了在研究癌症时超过十年的地面工作的高潮基因组,“Abvie的首席科学官员和国际癌症基因组联盟的创始人汤姆哈德森博士说。”当我们在2007年推出ICGC时,这一幅度的主动性是前所未有的。我很高兴,科学界已经聚集在一起生产这种综合研究,这提高了我们对癌症的理解,促进了癌症患者的新药的发展。“
“ICGC的最新倡议称为ARGO(加速基因组肿瘤学)是关于患者的,目标是为世界提供100万患者的精确肿瘤学知识,以改善人类健康。该数据必须在传统的司法管辖范围内分享这一数据实现精密医学的全部影响,因为所有人的利益。“Andrew Biankin Ao博士,雷沃斯·沃尔河癌症研究中心阁下和Glasgow大学威尔士博士研究中心主任,以及国际癌症基因组联盟执行董事。
“使用癌症基因组地图集地址(TCGA)创建的数据和基础设施作为蓝图,PCAWG进一步提高了对癌症的理解,并加强了我们开发成功的国际项目的能力,”Jean Claude Zenklusen,PH博士说.D。,国家癌症研究所(NCI)主任TCGA计划办公室主任。
“除了受益于癌症研究领域之外,这一合作还致力于许多捐赠样品以TCGA的患者赋予其有限的组织有限的组织礼品,”全国Carolyn Hutter博士说。人类基因组研究所团队领导TCGA。
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