研究人员展望下一代遗传测序，以深入了解Covid-19

它可能是常见感染的诊断测试的未来，并且可以证明是理解和打击新型病毒的重要工具。下一代遗传测序 - 或下一代测序（NGS） - 在研究中变得越来越常见，尽管它仍然没有广泛可用。在UNC学院，它是研究合作的一部分，以更好地了解病毒肺部感染，包括Covid-19 - 席卷世界的新型冠状病毒。

“我们可以使用NGS，该NGS检测来自患者的给定样品中的所有病毒，以使我们的当前测试正常工作以识别Covid-19病毒，“德克迪默，博士，博士，普利病毒基因组学核心主任和Laneberger综合癌症中心成员。

NGS不仅识别样本中存在的所有病毒，但序列或解码剂的病毒的DNA。通过病毒的基因组代码筛选能力，可以深入了解它的年龄，它来自哪里，并且如果它发生突变。

“这就像拍摄病毒的指纹一样，”Dittmer说。“它允许我们探索一个样本并越来越深，看看我们发现的东西。它可以帮助我们了解许多事情，包括为什么有些人从病毒生病，其他人没有。”

用于快速检测流感或呼吸道感染的标准诊断测试仅寻求有限数量的预定病毒，并且不提供超出正面或负面结果的信息。用于诊断Covid-19的测试也是如此。这测试由UNC研究人员开发，寻找病毒基因序列的一部分，导致新的冠状病毒。

“因为我们只是看着病毒的一种基因序列，我们必须不断监测该基因序列的变化，以便我们可以放心，我们的测试仍然可靠，”UNC的主任博士说。“医疗中心微生物学和分子微生物学实验室。“NGS将帮助我们这样做。”

Miller和Dittmer正在合作，以保持Covid-19尽可能准确。在UNC经历了FDA的确认过程后，获得了北卡罗来纳州公共卫生实验室证实的前五个积极和前五个负面结果 - 第一个阳性100标本将进入DITTMER的实验室进行进一步的测序研究。

“米勒说：”它肯定有助于我们对可能存在的其他病毒的疾病和其他病毒的疾病和繁殖的整体知识。“

Dittmer和William A.Fischer，MD，肺病疾病和关键医学教授，是本月在流感和其他呼吸病毒杂志上发表的研究的相应作者。该研究的牵头作者是Subhashini A. Sellers，MD，肺病患者助理教授和临界护理医学。该研究的目标是确定艾滋病毒患者呼吸疾病的负担。为了确保所有病毒和细菌都被占样品，Dittmer和他的同事将NGS与患有呼吸症状的人民患者的患者，流感病毒和其他感染的标准诊断测试进行了比较。

“我们使用了NGS，因为担心艾滋病毒的人们易受在护理试验标准的病原体面板上的病毒，”卖家表示。““在我们的标准测试中，我们发现了一种鼻病毒的菌株，但是当它被遗传测序时，我们看到它比我们看到的通常菌株更独特。NGS可以帮助我们跟踪这种信息，这在快速检测和追踪新颖方面很重要感染和社区爆发。“

“到那个时刻新的病毒，您可以确定病毒的遗传序列，并将其与所有已知病毒的数据库进行比较，“Dittmer说。”通过使用遗传测序，之前发现Covid-19最接近的“亲戚”是一个新冠病毒发现在蝙蝠。“

DITTMER正在使用NGS的临床试验，以确保Covid-19测试更准确。与此同时，他的实验室将继续与米勒博士合作。

DITTMER说：“这是UNC SOM在UNC SOM在伟大的研究环境中允许我们的社会聚集在一起并贡献更多的例子公共卫生努力。”

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