美国研究人员在Covid-19爆发期间与科学家合作
汇总研究的研究可能是一个具有挑战性和耗时的过程,进一步提升,因为目前的Covid-19情况,在其中非必要的实验室已被休眠,许多研究人员现在正在单独和远程工作,而不是在内部工作而不是合作相同的空间。
尽管那些障碍,印第安纳大学医学院学院和再生研究所研究科学家们已经发表了他们的研究自然通信4月14日,考虑到其中一位领导作者在中国武汉被隔离了,这是一个更为幅度的壮举,这是在中国武汉的最后两个月的工作。
该团队由附属科学家Jie Zhang,Ph.D.,博士,博金,博士,博士,印第安纳大学医学院议员,君成,深圳大学博士,梁Cheng, M.D. of IU School of Medicine.
这项研究是由印第安纳大学医学院医学和分子遗传学助理教授张博士领导的。工作重点是机器学习的应用和图像分析通过在显微镜水平上检查细胞和组织的特征,帮助研究人员从其他亚型中区分一种罕见的肾癌亚型(易位性肾细胞癌,简称tRCC)。张博士表示,结构上的相似性导致了很高的误诊率。在这份出版物中,研究人员研究了74个tRCC样本,构成了世界上最大的tRCC收集。
“这种TRCC的表型看起来非常像透明细胞肾细胞癌,或CCRCC,最常见的类型肾细胞癌,因此,病理学家可以区分两者,“张博士说,”张博士“。为改善,我们试图使用机器学习技术,在数字化的病理图像数据中喂养到分析管道以训练计算机提取与TRCC相关的功能。这将有助于病理学家确认这种情况,而不是只是依靠他们的眼睛。“
本文的第一个作者,君成博士开始与博士合作。张和黄在2016年,君程博士是一个博士学位。来自中国的学生。他在博士时第一次访问过。张和黄是俄亥俄州州立大学的研究人员,在他们加入IU医学院和再生学院,并且由于他们转移到他们目前的角色以来也访问了他们。君成博士目前是深圳大学助理教授,并向武汉的家乡骑马休假。
“我本来打算在家待10天,”程军博士说。“三天后,武汉全城封锁(出于对新冠肺炎的担忧),封锁持续了两个多月。”
武汉市成为大流行的震中,拥有超过50,000名Covid-19的Covid-19案件,其中1100万人。由于他正在努力修改他们的出版物,Cheng博士不会在深圳大学返回他的实验室,因为留下假期的教师和学生都不被归功于由于大流行而回归。他家里只有一台笔记本电脑,但需要一个高性能的计算机来进行数据分析。
“幸运的是,在寒假期间,我实验室里的一个学生没有回家,在学校住在学校,”君程博士说。“她帮助在我的实验室中启动了电脑,然后我在远程上完成了所有实验。”
君诚博士还需要重复修订的稿件的一些分析,这需要将先前将公共数据转移到中国印第安纳博士的中国,并且需要一周的时间来完成数据转移。
“在检疫期间修改出版物是非常紧张的,但最后我们制造了它,”君君博士说。
黄博士将这篇论文描述为真正的团队科学努力,包括国内和国际合作,他说这两者都是必不可少的。梁,MD,维吉尔月球IU医学院的病理学教授和相应的作者之一,能够收集额外的tRCC和ccRCC样本在两周内从一个合作者在密歇根的额外的分析,他说这是一个了不起的成就。
“在许多情况下,我们进行国际合作,因为有一个巨大的创新基础可以帮助我们的研究,”黄博士说,他也是国际大学精确健康倡议的数据科学和信息学主任。“即使在困难时期,只要我们有足够的资源和沟通手段,我们仍然可以进行合作研究。”
本研究侧重于基于遗传标记而不是疾病的位置肾癌。本研究部分受到IU精确卫生倡议的支持。
武汉市本月早些时候重新开放。
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