截至3月5日,巴西输入的新冠肺炎病例中54.8%来自意大利
根据巴西研究人员与英国、加拿大和美国同事合作进行的一项研究,意大利是第一批将新型冠状病毒带到巴西的人的主要来源地。2019冠状病毒病大流行于2月至3月初抵达巴西。
“中国和其他国家的疫情开始缓慢,病例数量很少,相比之下,巴西是由300多人开始的,其中大多数来自意大利。结果病毒传播得非常快,”该研究的作者之一埃斯特·萨比诺说。萨比诺是São保罗大学医学院(FM-USP)的教授,并在2015年至2019年期间担任该大学热带医学研究所(IMT-USP)的负责人。
这些人大部分来自意大利,前往巴西第一例病例被通报的São保罗市,但也有一些人去了其他目的地,包括里约热内卢里约热内卢、阿雷格里港、萨尔瓦多、库里蒂巴、贝洛奥里藏特、福塔莱萨、累西腓、Vitória和Florianópolis,促成了疾病在全国范围内的传播。
这项研究得到了巴西-英国虫媒病毒发现、诊断、基因组学和流行病学中心(CADDE)赞助的São保罗研究基金会- fapesp的支持。研究结果发表在《科学》杂志上旅行医学杂志.
研究人员估计,截至3月5日,巴西输入的所有COVID-19病例中,54.8%来自意大利感染者,其次是来自中国(9.3%)和法国(8.3%)的乘客。
他们还估计这一比例为24.9%受感染的人在此期间飞往巴西的航班从意大利飞往São保罗,意大利是受感染旅客前往巴西的10条主要路线中的5条的起点(途经中国、法国、瑞士、韩国和西班牙)。
为了确定将COVID-19输入巴西的主要途径,研究人员分析了2020年2月至3月从29个有确诊病例的国家前往巴西任何机场的乘客的数据。
他们根据截至2020年3月5日期间飞往巴西任何机场的乘客总数、国家人口和这些国家通报的病例数,估计了可能从每个国家和每条航线抵达巴西城市的受感染旅客的比例。
这些估计得到了巴西卫生部关于通报病例的官方数据的证实,数据显示,在巴西最初诊断出的29名COVID-19患者中,有14人刚刚去过意大利。其中6人(23.1%)在São Paulo收到通知。
萨比诺说:“很明显,São保罗将成为巴西疫情的中心,因为它是主要来自意大利的最多感染者的最终目的地。”
关注内部流动性
萨比诺领导了从巴西前两例COVID-19确诊病例中分离出的冠状病毒的基因组测序工作。他说,目前这种疾病在社区中持续传播,当局应集中精力限制内部流动,以遏制疫情。
这意味着限制São保罗居民的流动性,巴西大多数确诊病例都已在那里得到通报。
她说:“São保罗和较小程度上的里约热内卢将成为病毒传播到全国其他地区的枢纽,所以应该防止人们离开这两个城市。”
继续测序
由萨比诺领导的研究人员继续对从被诊断患有COVID-19的巴西人身上分离出的SARS-CoV-2进行测序。他们一度不得不停止,因为他们的一些成员被认为已经感染了。
萨比诺说:“我们不得不关闭实验室,但我们现在回来了,将分析我们是否可以对更多的病毒基因组进行测序。”
这种疾病在巴西蔓延的速度打乱了该组织的计划。萨比诺说:“病毒的传播速度非常快,测序数据无法帮助我们了解疫情是如何按照我们的计划传播的。”
研究人员希望能够在报告散在病例时对病毒进行测序,以便跟踪传播轨迹,并有助于设计遏制策略,但同时到达实验室的病例数量太高了。
“仅靠测序是不可能控制疫情的。它传播得非常快,我们无法再追踪所有病例,”萨比诺说。
全世界从感染患者身上测序的基因组数量已接近800个。Sabino解释说,这些序列正在被公开,可用于原发性耐药性的研究,以帮助开发有前景的抗病毒药物。
她说:“当一种候选药物被发现时,一个病毒基因组序列数据库肯定会对此有用。”
进一步探索