基因组追踪揭示了广东省Covid-19的上升和下降

牛津大学(Oxford)和广东疾病预防控制中心(Guangdong Centre for disease Control and Prevention)的研究人员领导的一项新研究描述了在中国人口最多的地区爆发的COVID-19疫情的流行病学和基因构成，并显示了早期和密集的检测和追踪如何帮助阻断了病毒在当地的传播。

该研究结合了基因组测序和流行病学，揭示了中国1月和2月的广东省爆发的三个阶段，今年：从其他中国省的广东引入新案件，广东省当地传播的崛起和下降最后从国际旅行者进入广东省的新案件。广东疫情是中国第二大，除湖北，武汉所在。

在广东省> 1亿人口的地区，测试迅速动员。到19月19日，Covid-19共有160万检验已确定1,388个阳性案件。提升监督在1月底开始旨在监测所有从湖北和其他省份爆发的旅客返回，他们在诊所的所有住院患者和所有住院患者中，即使它们没有症状，也没有已知的受感染者的暴露。

通过分析受感染个体的基因组，研究人员确定，广东的疫情不是由一个大型传播链引起的，而是数百种来自该省以外的独立传入。局部传播的感染链显示为遗传信息在规模和持续时间上受到限制。研究人员说，这说明广东实施的筛查和干预措施在阻断当地传播方面是有效的病毒。

该研究还表明，近乎实时的SARS-COV-2（导致Covid -19的病毒）的基因组可以迅速排序和分析。由于这种爆发的速度和性质，尝试了不同的实验方法。使用手持式碎序列测序装置（由牛津纳米孔技术开发）和由艺术网络开发的测序协议获得了良好的结果。

作者有信心研究中国早期Covid-19流行病的方法可以扩大，并适用于世界各地的其他Covid-19爆发。

牛津大学马丁学院和动物学系的资深作者奥利弗·皮布斯教授和其他作者现在是英国COVID-19基因组学联盟的主要成员。该联盟已经对英国>3000的基因组进行了测序，并对其进行分析，以追踪传播并了解病毒是如何进化的。

奥利弗·普博斯教授说：“我们已经知道对Covid-19基因组的变化比其他病毒如流感的其他病毒变得更慢。这意味着Covid-19病毒正在比IT突变移动和传输更快。因此，分析的是至关重要的病毒基因组合结合详细的流行病学信息，即我们在本研究中取得的成就。“

未来，这些基因组数据将不仅用于了解病毒如何在不同位置传播，还将用于追踪各种病毒遗传变异这些知识对疫苗和抗病毒药物的研究人员至关重要。

广东省疾病预防控制中心广东省公共卫生研究所的陆静博士说:“为了获得最好和最有力的见解，我们需要结合病毒基因组具有流行病学和其他数据的信息。我们在广东省的工作表明，高水平的早期测试，以及积极的案例跟踪和严格的隔离，可以带来一个爆发控制。”

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