研究表明，祖先和癌症的分子组成之间存在联系

自2003年人体基因组项目完成以来，关于癌症研究的癌症族族印记的问题已悬停在癌症研究中。肝癌是否与非洲人血统人类的基本，分子水平不同？乳腺癌是否比美洲原住民有不同的遗传概况？

NCI癌症基因组分析网络是一个与美国、加拿大和欧洲的研究人员合作的小组，该组织的研究人员的一篇新论文提供了迄今为止最全面的关于祖先对正常和癌变组织的分子组成的影响。根据癌症基因组图谱(TCGA)的数据，研究人员发现，10,678名患者和33种癌症类型的祖先与数百种基因的变异有关，但其中最重要的差异与特定的组织类型有关。这项研究今天由癌症细胞。

“我们发现，在不同的祖先患者中，对应于这些差异的分子特征主要被限制在特定的器官和组织类型中，”达纳飞行和广泛的研究所，达纳斯·巴特尔斯和广泛的研究所与安德鲁Cherniach，博士，达纳 - 法尔伯和广东学院的集团领导者的学习作者。“这表明跟踪祖先的分子效果 - 既正常和癌症组织 - 需要采取组织逐组织的方法。”

研究人员的具体发现如下:

• 从分子的角度来看，非洲血统的人患肾癌的类型与欧洲血统的人不同。非洲种的VHL基因突变使VHL基因失效，从而促进肿瘤新生血管的生长，这种突变不太常见。
• 东亚地区膀胱癌患者产生免疫系统反应的迹象少于欧洲地区膀胱癌患者。

在研究中，研究人员使用各种分子技术来确定分析组织样品的患者的血汁。患者被归类为主要是欧洲，东亚，非洲，本土/拉丁美洲或南亚血统。患者至少将20％混合的患者被归类为混合血统。（这些患者被其主要血统患者分类，如非洲 - 混合，欧洲混合等）作为一组，患者有33种，其中13种，其中13种进一步分为亚型。

TCGA对每个病人的组织进行了深入的分析，检测癌变和普通细胞用于一系列分子特征。这些包括突变(DNA的错误复制部分);DNA甲基化的模式(一个影响基因是开启还是关闭的过程);信使RNA(一种携带转录版本的DNA并指示基因活性的分子);和microRNA(一种帮助或阻碍基因活动的RNA形式)。NCI癌症基因组分析网络的研究人员利用这些数据来观察这些特征的差异是否反映了祖先的差异。

“我们发现，与祖先相关的差异跨越了所有这些特征，并存在于数百种不同的基因中，”Cherniack说。“然而，结果证明，最显著的差异——影响细胞功能以及与身体其他部分相互作用的差异——具有深刻的组织特异性。”尽管祖先影响了大多数癌症类型的分子特征，但这些影响在不同类型的癌症中并不相同。例如，可追溯至非洲血统的肺癌的分子差异，在乳腺癌、胰腺癌或其他癌症中没有发现。

这些数据也使研究人员能够询问，与祖先有关的正常细胞的特征是否会延续到这些细胞的癌变版本中——例如，欧洲人提取的肺细胞的分子特征是否也会在肺中发现癌症细胞这些人。他们发现这是绝大陆的情况。“大多数具有特定祖先的人的正常组织的差异在癌症中均衡，”Beroukhim陈述了。此外，证据表明，这些差异中的一些可能有助于在有类似背景的人们中发展某些癌症。

该研究的作者说，获得来自混合血统患者的数据被证明是一项资产。研究人员对5个族谱组中血统至少占80%的患者进行了初步分析。随后，他们对混合人群的数据进行了类似的分析。“当这两项分析的结果吻合时——当一个祖先组的分子差异也出现在该祖先组和其他祖先组的结合患者身上——这是最初发现的有效性的特别有力的证据。”达纳-法伯和布罗德大学梅尔森小组博士后研究员。Beroukhim说:“混合背景的患者是研究癌症祖先的分子效应的一个特别强大的群体。”“它帮助我们缩小了导致这些差异的基因组区域。”

这项研究的综合性揭示了以往将种族和祖先与细胞分子元素联系起来的努力的一些缺点。首先，这样的研究倾向于把不同的亚型混为一谈癌症Beroukhim说，尽管在某些祖先中，某些亚型比其他亚型更常见，但这两种亚型在一起是很常见的。一些用于解剖分子特征的技术也可能扭曲了以前的研究结果。

研究人员尚未确定祖先之间的分子差异是由环境因素还是遗传因素造成的。然而，他们确实发现了祖先之间的基因差异，这可以解释他们的许多发现。

“我们的发现表明，需要更多来自不同祖先的样本来进行真正全面的研究祖先Beroukhim说。“这项研究代表了朝这个方向迈出的重要一步。”

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