研究人员测试了亚利桑那州北部废水，以便对COVID-19暴发进行早期预警

随着covid -19大规模检测的持续挑战——包括检测试剂盒短缺、严格的检测标准以及目前针对轻度症状和无症状人群的追踪系统的固有局限性，科学家们正在寻找其他方法来加强检测，以预测疾病的传播。NAU信息、计算和网络系统学院(SICCS)的助理教授Crystal Hepp正在亚利桑那州北部社区测试废水，以帮助确定导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的传播。因为这种病毒是通过人类粪便传播的，她认为污水是检测这种病毒的可行途径。

虽然科学家预测第二次甚至多个Covid-19爆发，但Hepp认为废水测试可以作为早期和正在进行的警告系统，特别是在农村社区的服务不足医护人员和医疗设施，并可以提醒废水厂运营商升高风险。

“继续有助于制定动态区域干预战略的监测活动至关重要，”HEPP表示。“在这种幅度爆发期间是可持续的，需要实施更强大，可行和独立的社区采样方法。”

目前，HEPP和她的团队正在每周测试流入（未经处理的）和污水（处理）样本在弗拉格斯坦，MUNDS Park，Kachina Village和Kayenta的六个地点，位于Navajo国家。该项目的合作者包括弗拉格斯塔夫市，松原卫浴区，帕银纳村改良区，纳瓦霍部落实用权和Tgen-North。

Hepp实验室的高级研究专家博士生吉尔宣扬，导致工作的实验室组成部分，并治疗每个样品，好像它是传染性的。

“我用这种材料去除核酸，”Cocking说。“COVID-19是一种RNA病毒（一种有核糖核酸的病毒遗传物质），所以下一步是将RNA转换成DNA，因此可以通过由疾病控制和预防中心设计的测定来检测它。该测定术后遗传物质拷贝，直到足以通过我们的仪器检测到它。如果是冠状病毒存在于废水中，这个分析会让我们知道。”

四月初，三个污水处理厂的样本检测呈阳性。Hepp是NAU病原体和微生物组研究所(PMI)的一名助理主任，他指出，该小组没有在废水中发现任何阳性病例，这表明废水处理厂的处理过程在治疗病毒方面是有效的。研究人员将对阳性样本进行基因测序分析，以寻找不同的菌株。

“病毒总是在进化，”赫普说。“总会有新的菌株出现。如果我们发现几种不同的毒株有不同的突变，这就意味着随着时间的推移，病毒有更多的机会在人群中发生突变，或者新的引入已经发生。在任何特定时间，菌株数量越高，可能意味着受感染的人越多。”

HEPP正在与PMI的助理主管Jason Sahl合作，他将使用他已建立的基因组管道WG-FAST，检查应变多样性。

“我们的WG-Fast方法可以提供病毒的应变水平鉴定，鉴定应变混合物和匹配临床和匹配废水“样本”，“Sahl说。”这种方法可以识别循环病毒，而不需要直接样本，并将独立识别病例。它还可以捕捉到医院可能不出席的Covid-19案例，并可以提醒公共卫生机构对流通菌株，这将有助于联系跟踪，并通知公众在其社区中的Covid-19新浪。“

“这种测序分析将帮助我们了解一个社区的流行毒株，病毒的总体多样性，以及它们如何在一年中的不同时间和不同地点发生变化，”副教授、TGen-North主任戴夫·恩格尔泰勒(Dave Engelthaler)说。

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