科学家对1000多个COVID-19基因组进行测序,以帮助应对大流行

科学家对1000多个COVID-19基因组进行测序,以帮助应对大流行
资料来源:谢菲尔德大学

作为谢菲尔德大学和谢菲尔德教学医院NHS基金会信托基金的科学家和临床医生的工作的一部分,目前已经制作了1000多个冠状病毒基因组序列。

这些数据是他们工作的一个重要里程碑,他们是英国一个绘制COVID-19传播、行为和突变方式的联盟的一部分。全文将于公共数据库用于研究全球冠状病毒爆发解决方案的研究人员和科学家。

在英国政府的支持下,这项2000万英镑的投资使英国各地的专家小组得以合作,快速分析在英国流通的冠状病毒样本的遗传密码。这项工作正在创造情报,与公共卫生机构、医院、地区NHS中心和政府共享,以帮助抗击病毒。

通过绘制COVID-19基因组图谱,科学家们可以在国家和全球范围内监测病毒的变化,进一步了解它是如何传播和变异的,从而为临床治疗患者提供信息,甚至挽救生命。

英国COVID-19基因组学联盟包括英国国家医疗服务体系、公共卫生机构、维康桑格研究所和包括谢菲尔德大学在内的众多学术机构。

Thushan de Silva博士是谢菲尔德大学感染性疾病高级临床讲师和名誉顾问医师,领导谢菲尔德COVID-19基因组组合作。成员包括来自大学的Florey宿主病原体相互作用研究所,谢菲尔德转化神经科学研究所(SITraN),动物和植物科学系,分子生物和生物技术系和计算机科学系的专家。

Matthew Parker博士和Dennis Wang博士一直在领导国家卫生研究所(NIHR)谢菲尔德生物医学研究中心和计算机科学系的生物信息分析项目。ob欧宝直播nba

帕克博士说:“利用谢菲尔德生物信息学核心的专业知识,我们已经建立了一个强大的管道,从我们地区的病毒病例中获取基因组数据,并将其与世界各地的病毒病例进行比较,以确定新的突变。通过与我们的国家和国际伙伴合作,我们将能够跟踪病毒的传播,我们在谢菲尔德拥有的设施和专业知识是这类项目成功的关键。

“我们的合作团队已经迅速扩大了其能力,并制定了新的过程,能够以我们以前从未做过的规模测序基因组。实验室工作人员目前正以每周超过100例的速度对COVID-19确诊病例的样本进行基因组测序。”

德席尔瓦博士说:“通过观察确诊病例的患者的整个病毒基因组,我们可以在国家和全球范围内监测病毒的变化,以了解它是如何传播的。

“这项工作正在帮助协调对新的传染病在当地人群中传播和变异的敏捷反应。这对于卫生研究界能够帮助我们理解新病毒的爆发是至关重要的向患者提供临床护理,甚至拯救生命。”

该团队与来自谢菲尔德教学医院NHS基金会信托地区NHS病毒学实验室的顾问病毒学家Cariad Evans博士、Mohammad Raza博士、Alison Cope博士和顾问微生物学家Dave Partridge博士合作,该实验室位于北方总医院;以应对约克郡地区迅速演变的病毒爆发。

Cariad Evans博士说:“我们的实验室有国内外的病毒学专家在工作,我们非常自豪能参与这项重要的工作,以确定这种新病毒如何表现,以及这些知识如何为未来的护理或治疗提供信息。”


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更多信息:COG联盟数据库可在以下网址访问www.cogconsortium.uk数据/
所提供的谢菲尔德大学
引用:科学家对1000多个COVID-19基因组进行测序,以帮助应对大流行(2020年5月15日),并于2021年5月5日从//www.puressens.com/news/2020-05-scientists-sequence-covid-genomes-aid.html检索
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