研究显示R-loops配合SOX2在调节重组多能性
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R-loops是独一无二的结构单元中,rna DNA组成的混合动力车和流离失所的单链DNA,通常发现在转录的基因。然而,R-loops也是动态的和广泛的实体,发挥不清楚监管和表观遗传作用的基因组。
最近的一项研究,发表在科学的进步和广州生物医药与健康研究院的研究人员(GIBH)中国科学院已阐明R-loops的活动重新编程体细胞诱导多能干细胞(万能)。他们透露,R-loops影响体细胞重编程的万能,和这个活动中断导致缺陷体细胞重编程的细胞万能。
R-loops可以作为表观遗传标记通过改变转录因子绑定,染色质的修改和DNA甲基化。研究人员绘制了景观R-loops OSKM (Oct4、Sox2 Klf4,原癌基因,四个转录因子在重组鸡尾酒)介导的体细胞重编程和显示一个动态关联R-loop形成和解散和体细胞重编程的过程。
“我们的数据表明,R-loops引起急剧变化在早期和晚期阶段的改变,但是他们有瞬态和微妙的变化在中间阶段,它显示了类似的模式与染色质,DNA甲基化,和基因表达在重组期间,”姚Hongjie说,这项研究的作者之一GIBH。
姚明和他的同事们发现,一些R-loops事先形成的基因表达,暗示R-loops平衡基因转录。他们的研究表明,转录因子Sox2山中(但不是任何其他因素重组鸡尾酒)与R-loops密切参与形成一个复杂的。
“这不仅是一种转录因子诱导转录还R-loops不可或缺的监管机构,保持平衡,并进一步促进重组一起R-loop-resolving因素,”姚说。
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