苏格兰首次引入冠状病毒可能发生在该国第一例确诊病例之前
科学家对苏格兰首次确诊的COVID-19病例的病毒样本进行了测序，确定了多次传入，主要来自意大利、奥地利和西班牙等欧洲国家，并表明苏格兰首次传入该病毒可能发生在3月1日该国第一例确诊病例之前。
为了在这一关键时期提供及时的信息，本研究已在medRxiv和完整的预印本研究上发表。值得注意的是，这些发现尚未经过同行评议。
通过观察引发COVID-19的SARS-CoV-2病毒的全基因组序列，研究人员发现，该病毒在苏格兰爆发的头四周至少被引入了113次，主要来自其他欧洲国家。已确认的与旅行相关的SARS-CoV-2传入苏格兰的情况早于英国的旅行限制和其他欧洲国家的广泛限制。
一些推断的病毒传入与报告的旅行没有关联，因此作者得出结论，病毒的一些早期传入未被发现，并迅速在苏格兰建立了社区传播。3月11日，也就是第一例发现病例10天后，明显出现了从旅行相关传播向持续社区传播的巨大转变。
这项研究调查了3月份在苏格兰出现的这种病毒。研究人员利用下一代测序技术获得了466个个体的全基因组序列实时20%的确诊病例。
格拉斯哥大学病毒研究中心传染病学教授艾玛·汤姆森说:“我们的研究证实，SARS-CoV-2是通过至少113种不同的旅行相关传入苏格兰人口的，导致了多个持续的社区传播聚集。我们早在首次发现感染后三天就确定了与旅行无关的病毒谱系，这表明在首次发现病例之前，病毒更早进入苏格兰并在社区传播。”
“欧洲大陆成为全球冠状病毒大流行的中心，显然是苏格兰疫情爆发的驱动因素，这项研究中检测到的大多数谱系与欧洲序列相关。与中国和东南亚其他国家有关的病例没有被发现。”
“在主要来自其他欧洲国家的多次引进之后，这种病毒在苏格兰和英国整体上蔓延的速度非常快。意大利等病例负担高的国家更早实施封锁，以及隔离来自高风险地区的旅行者等其他措施，可能已经阻止了疫情的升级和持续的多个社区传播集群。”
“跟踪新的冠状病毒使用测序和物种流行病学分析可能有助于我们当前的反应和实时公共卫生干预的效果，是一个工具，可以用来了解未来这种性质的传染病暴发。”
病原体基因组测序已成为流行病应对病毒爆发的核心组成部分，例如刚果民主共和国的埃博拉病毒或中美洲的寨卡病毒。在这项研究中，一直在乌干达使用这种技术的格拉斯哥大学病毒研究中心(MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research)的研究人员与苏格兰西苏格兰专家病毒学中心(West of Scotland Specialist Virology Centre)和爱丁堡皇家医院(Royal infirths of Edinburgh)的NHS合作伙伴一起，转向对苏格兰SARS-CoV-2病毒进行测序。由此得到的数据使科学家加深了对该疾病的起源和传播的了解，通过分析COVID-19在苏格兰的引入情况，有关病毒的范围和传播的信息有助于为有针对性的公共卫生干预提供信息。
汤姆森教授补充说:“随着苏格兰病例数量的减少，我们的序列数据可以为持续感染的实时排序提供基线，这可以作为决策者当前措施成功的一种措施，并有助于放松或收紧公共卫生措施。”
爱丁堡大学临床科学家顾问凯特·坦普尔顿博士说:“这种测序方法的引入是格拉斯哥大学和爱丁堡大学之间的伟大合作。爱丁堡的这项研究是与英国大学和英国国家医疗服务系统的科学家共同完成的。正在进行的工作依赖于整个苏格兰的NHS临床和诊断实验室工作人员的贡献。他们的努力帮助我们建立了一个真正的国家图景的介绍和正在进行的传播病毒并将提供重要信息，指导决策者如何应对这场大流行。”
在采样期间(2020年2月28日至2020年4月1日)，共发现COVID-19阳性病例2310例(苏格兰公开数据，statistics.gov.scot)。这些确诊感染与1832例入院、207例重症监护和126例死亡相关。
该研究题为“SARS-CoV-2在苏格兰传播的第一个月的基因组流行病学突出了欧洲旅行在COVID-19出现中的作用”，发表在medRxiv上。
用户评论