小型研究表明,样本失活可能导致SARS-CoV-2假阴性
![Credit: CC0 Public Domain 病毒](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2020/virus.jpg)
为了保护医疗实验室人员在检测SARS-CoV-2临床样本时不受感染,大多数实验室在检测前会灭活病毒。灭活对检测结果的影响尚未确定,但一次灭活病毒检测的假阴性率估计在30%至50%之间。
由西安市疾病预防控制中心的马朝峰领导的研究小组假设,病毒失活可能导致假阴性。他们现在已经测试了几种灭活方法,以确定它们是否以及在多大程度上减少了临床中可检测到的病毒样本.这项研究发表在临床微生物学杂志是美国微生物学会(American Society for Microbiology)的刊物。
调查人员采取了临床样本来自63名感染SARS-CoV-2的患者。他们首先使用一种称为数字PCR的技术来确定每个样本中病毒颗粒的总数。
然后,他们灭活了样本中的病毒,并确定了基因组中两个位点的病毒可检测量减少了多少,一个是编码“核衣壳”蛋白的基因,另一个是称为ORF 1ab的基因组片段。
第一个灭活处理使用了一种名为TRIzol的试剂,破坏了47.54%的核衣壳基因和近40%的ORF 1ab。
第二次失活处理将样品加热到56°C 30分钟,两段基因组的数量分别减少了48.55%和56.40%。加热到80°C 20分钟可以进一步减少病毒拷贝数量,在121°C煮沸或高压灭菌几乎没有被检测到病毒.
研究人员写道,未来的研究应该包括除TRIzol外的灭活试剂。但现在,“……TRIzol推荐用于样品失活…因为TRIzol对RNA拷贝数的影响是所有测试方法中最小的。”