圣裘德云门户网站扩大了儿童实体肿瘤数据宝库的访问

本周，一个创新的、交互式的基于云的数据门户网站首次亮相，该网站允许学术研究人员挖掘世界上最大、最全面的科学资源，用于研究儿童实体肿瘤及其相关生物学。的儿童实体肿瘤网络（CSTN）数据门户网站在St. Jude Cloud上创建，以改善通过网络获得的详细数据，刺激新颖，救生疗法的研究和开发。

CSTN包括广泛的数据，170个来自患者的样本，代表21个不同的儿童实体瘤，包括神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤和罕见肿瘤。这些样本是原位病人来源的异种移植物，这意味着人类肿瘤样本被植入并在小鼠的相应位置生长。

肿瘤样本和相关数据分享学术研究人员不收费，也没有合作的义务。圣犹达发展神经生物学系主任Michael Dyer博士和圣犹达肿瘤学系的Alberto Pappo医学博士于2013年推出了这个网络。其目标是加速该领域的发现。“在过去的三十年里，对于患有实体瘤的儿童来说，没有明显的改善，”Dyer说，他是霍华德·休斯医学研究所的一名研究员。小儿实体瘤是发育性肿瘤。为了了解肿瘤是如何开始、生长和扩散的，需要对它们生长的环境进行研究。

Dyer说:“随着人们对这个网络的兴趣增加，我们意识到科学家需要更深入地挖掘数据。”“我们创造了互动浏览器，使之成为可能。”本周，CSTN数据门户网站在美国癌症研究协会(American Association for Cancer Research)虚拟举行的年度会议上公布。

基于网络的数据

该门户网站使研究人员更容易下载和分析自己的数据。

可用数据和分析工具包括：

• 患者肿瘤，种系和原位患者衍生的异种移植物的下一代，全基因组测序。这些被呈现为交互式应用程序，允许定制的热带代表突变和个体基因搜索。还上载原始基因组序列和可用。
• 表观遗传学的交互式浏览器，在某些情况下，蛋白质组学数据
• 组织学图像具有组织特异性污渍和电子显微镜图像，每个倍率为每个倍率样本
• 匹配患者样品和原位异种移植物的克隆分析
• 样品级搜索和可视化特定表征数据，让用户按因素过滤，例如患者年龄在诊断或初级与复发性肿瘤中

临床前药代动力学报告，肿瘤传播方案等

病人和病人移植的同种异体移植的单细胞RNA测序正在进行中。当更多的肿瘤样本和数据可用时，将被添加到网络中。

学术研究人员还可以从原位患者衍生的异种移植物以及新鲜的冷冻组织或细胞和福尔马林固定的石蜡包埋的组织块中要求冷冻保存细胞。

截至2020年6月，全球超过100个机构的200多名研究人员已要求并收到来自网络的1,500多个肿瘤样本。

“我们认为网络和数据门户是最好的方式来充分利用瘤发育神经生物学博士阿萨·卡尔斯特伦说:“孩子们和他们的父母捐赠的组织样本为加速治疗和了解疾病提供了资源。”她是一篇关于网络数据门户，包括在AACR海报会议。

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