跟踪隐秘肽
通过使用一种新开发的方法,来自Würzburg大学的研究人员,与Würzburg大学医院合作,首次能够识别出细胞表面的数千种特殊肽。他们能够证明这些所谓的隐肽标记了相当大比例的肿瘤细胞。这些发现为癌症免疫治疗提供了一个新的起点,并发表在著名杂志上癌症免疫学研究。
几乎所有的细胞人类白细胞抗原或HLA多肽在其表面存在细胞蛋白片段,在人体白细胞抗原或HLA多肽中起重要作用免疫反应。如果免疫系统检测外源HLA肽,例如病毒感染的细胞或肿瘤细胞上突变肽的病毒肽,T细胞消除相应的细胞。在细胞上呈现的全部HLA肽被称为细胞免疫肽体。
新方法首次实现全面分析
除了通常的HLA肽外,还有神秘的HLA肽。这些来自特定的RNA序列,其不包含特定蛋白质的信息,如通常情况。在过去的几十年中,只鉴定了少数神秘的HLA肽,因为它们非常小并且在细胞中迅速降解。另一方面,缺乏用于分析的有效计算机算法。
以一种全新的方法,Würzburg科学家现在已经结合了几个分析方法特别适合小肽。Andreas Schlosser博士解释说:“使用我们开发的一种新的生物信息学方法,我们第一次能够在各种各样的肿瘤,如黑色素瘤和乳腺癌的免疫肽组中识别出数千种隐型HLA多肽。”德国巴伐利亚鲁道夫·维尔肖中心Julius-Maximilians-Universität (JMU) Würzburg研究小组组长。
新的生物信息学方法专门基于数据质谱,一种测定分子(如肽)质量的方法。这使得系统和全面地确定HLA隐型多肽成为可能。此外,可以阐明细胞和神秘的肽在多大程度上存在:“我们能够表明,神秘的HLA肽组成的immunopeptidomes肿瘤的重要组成部分,“弗洛里安·艾博士教授解释说,在JMU病毒学研究所的组长。
免疫系统的有效攻击点
从个体研究中已知,隐秘肽可以触发自身免疫反应,例如糖尿病类型1以及针对肿瘤细胞的免疫应答。新分析提供了证据表明某些隐秘HLA肽仅在肿瘤细胞上发现。因此,这种肿瘤特异性隐蔽HLA肽可以因此证明是癌症免疫治疗的价值靶标结构。Würzburg大学和威尔茨堡大学医院的科学家已经检查了确定的肽,以确定它们是否适合作为癌症免疫疗法的靶标。
病毒感染的细胞还存在可以用作疫苗的靶结构的隐秘HLA肽。通过其新方法,研究人员因此有一种有效的工具,可以了解有关一般功能和隐秘的形成肽。Schlosser说:“我们希望我们的生物信息学方法将为我们更好地理解自身免疫反应以及免疫反应对肿瘤细胞和病毒感染细胞。”
进一步探索
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