科学家揭示全面的人类肺腺癌的蛋白质组图谱

一组中国科学家从药物研究的国家重点实验室,上海药物学研究所中国科学院,以及多机构合作者最近报道的一个全面的蛋白质组学分析基于103中国患者肺腺癌(LUAD),在所有类型的癌症死亡的主要原因。

研究显示LUAD-related分子特征,与临床结果,潜在的预后生物标记和药物靶点。这项研究发表在网上细胞7月9日。

尽管在基因组研究取得了显著进展LUAD近年来,很大一部分LUAD病人仍然缺乏有针对性的治疗策略。因为蛋白质是生物活动的直接执行者,全面的蛋白质组学研究LUAD可以填补之间的知识差距基因组异常和致癌蛋白功能。

提供一个全面了解的分子景观LUAD并提供更精确的诊断和治疗的机会LUAD,这项研究的科学家进行整合蛋白质组学和phosphoproteomic分析肿瘤组织及其配对的非癌变相邻组织从103年LUAD病人。总共有11119 22564磷酸化蛋白质和网站被确定。这些蛋白质组学数据结合临床资料和基因组学数据,综合分子景观LUAD。

科学家们发现,epithelial-mesenchymal过渡,以及炎症和致癌信号通路,可能导致阶段我LUAD预后不良。他们进一步基因改变和蛋白质组学特征之间建立连接的表皮生长因子受体突变患者或TP53,两个主要驱动基因在中国LUAD病人。

升高表达水平两个组织的标记,TTF-1 Napsin-A,蛋白质剪接体观察患者表皮生长因子受体突变。TP53突变患者,几个致癌途径,包括DNA复制和错配修复,是改变明显。

研究人员分类所有患者分成三个蛋白质组亚型(骶髂关节,s ii, S-III),每个都包含不同的分子特性和临床特征。综合生物信息学分析表明,骶髂关节患者与细胞环境,预后良好。相比之下,S-III患者与细胞增殖和蛋白质组相关稳定性和不良预后。phosphoproteomic分析进一步揭示了激活信号通路和在不同的蛋白质激酶亚型。的综合分析蛋白质组学数据和临床数据进一步显示27个潜在的等离子体生物标志物和几个LUAD的药物靶点。HSP 90β,一个潜在的生物标记物,进一步验证了一个独立的群体。

这项研究提供了新的见解LUAD超出了当前基因的理解。的蛋白质组学数据集作为一个有价值的和强大的资源加快基础研究转化为更精确的诊断和治疗在临床实践中。

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