空间映射方法查明狼疮中潜在的新治疗靶标

来自费城儿童医院（CHOP）的一组研究人员使用了一种新方法来确定基因组引起疾病的潜在变化，以识别狼疮的两个新的潜在治疗靶标，同时为更准确地识别引起疾病的变化铺平了道路其他自身免疫性疾病。这些发现是在线发布的自然通讯。

全基因组关联研究（GWAS）利用了整个基因组的变化，这是一个人的基因和相关DNA的完整集，以了解有关可遗传疾病和特征的更多信息。这些研究通常鉴定出可能导致特定疾病的数百种单核苷酸多聚噬细胞或变体的簇，但是研究本身无法识别哪些疾病是造成的。这是因为绝大多数变体不在基因本身中，而是在中间的DNA中，而GWAS不一定求解哪些基因受疾病相关的多态性影响。

全身性红斑狼疮是一种自身免疫性疾病，没有已知的治愈方法会影响儿童和成人，在种族少数群体中的患病率更高。狼疮的几项研究集中在幼稚的辅助T细胞和其他研究上血细胞，这项研究旨在专注于卵泡辅助T细胞，该细胞在与狼疮有关的免疫反应中起着更重要的作用。研究人员没有使用典型的GWAS方法，而是着手创建三维图，这些图与它们可能调节的基因相匹配。他们的方法使用变体作为“路标”来识别正常组织中的潜在基因增强子。

“在这项研究之前，该狼疮相关的细胞类型没有生成3-D结构基因组图，” CHOP时空间和功能基因组中心联合主任Andrew D. Wells博士说。，以及该研究的共同培训与Struan F. A. Grant博士一起“采用我们的方法，我们相信我们可以识别出在狼疮中没有已知作用的基因和途径。”

使用这种方法，研究团队确定了393个变体基因在3-D中，因此有可能参与其调节。这些变体中约有90％的变体在一个维度上被认为与其基因相距遥远，但实际上在团队创建的适当的三维图中很接近。研究人员能够查明两个在狼疮中未知作用的激酶Hipk1和Mink1。当这些酶靶向卵泡辅助剂T细胞，它们抑制白介素21的产生，这是一种参与调节抗体生产的细胞因子。

威尔斯说：“我们认为，HIPK1和Mink1可能是狼疮的宝贵治疗靶标，这种疾病迫切需要新的治疗选择。”“我们还希望采用我们在本研究中使用的方法，并将其应用于其他自身免疫性疾病，并帮助查明更多的因果变异，否则可能仅被GWAS掩盖了。”

威尔斯还表示，他们的团队希望开发HIPK1转基因小鼠模型，以研究其对实验性狼疮的敏感性，以及HIPK1对抗病毒免疫的潜在影响。