568个基因被鉴定为可能引发癌症的基因

对来自66种癌症的28000个肿瘤的基因组进行分析后，鉴定出了568个癌症驱动基因

由巴塞罗那IRB生物医学基因组实验室进行的这项研究对整合癌基因组学(IntOGen)平台进行了重大更新，旨在识别突变癌症司机基因。

出版于自然评论癌症，该结果提供了迄今为止最完整的癌症驱动基因概要快照。

癌症是一组疾病，其特征是由突变和细胞基因组的其他改变引起的不受控制的细胞生长。一个肿瘤可以出现数百到数千种突变，但只有少数对其致瘤能力至关重要。这些关键突变影响癌症驱动基因的功能。找到携带这种癌症驱动突变的基因是研究的主要目标之一癌症研究。

在ICREA研究员Núria López-Bigas的带领下，来自巴塞罗那IRB生物医学基因组实验室的研究人员对66种癌症的大约28000个肿瘤进行了广泛的计算分析，并确定了568个癌症驱动基因。这些关键基因在调节细胞生长、细胞周期和DNA复制等方面起着特殊的作用。这些基因的突变，赋予了恶性细胞快速无休止繁殖的能力，逃避了免疫系统和其他防御系统，传播和入侵其他组织，改变环境，使其受益，在其他能力。

“驱动基因的概要为临床和基础研究领域的癌症研究人员提供了关键知识，它对临床决策有重要影响，”López-Bigas说。“例如，如果我们知道肿瘤的致瘤能力依赖于一种特定的蛋白质，一种被批准的靶向治疗——即。，抗体或其他阻碍其功能的抑制剂——可能被肿瘤学家用来治疗病人，”她补充说。

大多数癌症司机基因是高度特异性的

通过鉴定568个癌症驾驶基因，研究人员已经观察到大多数是高度特异性的，并且其突变能够仅触发几种肿瘤类型。但是，有一个小组，占少于2％的鉴定，这是非常通用的，可以推动20多种不同类型的癌症。“虽然已知癌症驾驶员基因具有不同程度的特异性，因为他们首次被确定，但是，拥有这些纲要的这种快照使我们能够以无偏见的方式解决这个问题，”生物医学研究助理的研究助理说基因组实验室，也领导了这项研究。

其他组的先前研究表明，癌症是癌症驾驶基因中的四种关键突变引起的。一些类型的癌症，其特征在于突变较少，这些基因仅存在一个突变，而其他突变通常呈现许多突变，例如结直肠和子宫肿瘤，最多可容纳10种基因组改变，如结构变体，基因拷贝数的变化，影响基因组的非编码区域的突变也有助于肿瘤发生。

正面选择作为指标

基因中的令人惊讶的突变模式，与中立下的预期不同，构成它们的信号积极的选择在肿瘤发生中。IRB Barcelona研究人员使用这些信号的阳性选择来识别突变驾驶基因。为了计算这些信号，需要对所有基因进行准确地建模中性下突变的累积，从而可以容易地发现任何基因的偏差。

正选择信号被用来识别突变驱动基因，例如，一个基因的突变数量异常高或突变的意外分布突变沿着基因的序列。在本文的最新文章中，在期刊上发布自然评论癌症，研究人员展示了开放存取的IntOGen平台的更新，包括对所有突变驱动程序的这些信号的计算值基因。“由于巨大的肿仓测序数据被释放到公共领域，”内部工程为系统更新提供了理想的基础设施，“生物医学基因组实验室的博士后研究员第一作者FranciscoMartínez-jiménez说。

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