单细胞RNA测序揭示了癌症细胞对化疗的不同反应
化疗通过攻击体内快速分裂的细胞起作用。但一小部分癌细胞可以抵抗它的攻击,从而使癌症最终卷土重来。
更好地理解为什么有些癌症细胞当别人死去时,你能生存下来化疗MICHIGAN大学罗格尔癌症中心的癌症研究员博士,博士博士更加有效。
使用称为单细胞RNA测序的技术,U-M的研究团队能够首次显示单个细胞在一个人口中癌症细胞对化疗造成的DNA损伤不同。他们发现,分为三组:激活基因控制细胞死亡细胞分裂, 或者压力反应发表在《科学》杂志上的一项研究结果显示细胞的报道.
“集体,我们观察到具有不同姓氏的细胞实际上具有完全不同的活化基因组,并且这些不同的”转录组族景观“在化疗中的DNA损伤后对细胞的命运决定,”研究和一个密歇根州医学分子和综合生理学副教授。
虽然DNA包含用于细胞的完整使用说明书,但转录到RNA的序列讲述了在给定时间内接通或断开的故事 - 也就是说,所以正在采取哪一组各个指令。转录组是给定细胞内的这些RNA序列的完整组。
应用单细胞技术
李指出,在科学家中,单细胞分析经常被比作水果奶昔。许多类型的研究测量的是一组细胞的特征或反应——一组对整体做出贡献的个体玩家的混合,就像奶昔中的水果。这可以提供有用的信息,但也可以掩盖个体之间的差异——细胞水平相当于奶昔中的草莓、蓝莓和香蕉。单细胞技术使这些个体差异得以梳理。
该研究分析了来自三种结肠癌细胞系的10,000多种细胞。细胞暴露于化疗剂氟尿嘧啶,其通常用于对抗结肠癌和其他类型的癌症.一些观察结果被额外的技术和不同的化疗药物复制。
“以前,科学共识DNA损伤导致相当统一的转录反应,而转录反应基于细胞中给定的基因表达水平,以被动的方式导致不同的细胞命运,”Lee说。“相比之下,我们发现,不同的DNA损伤反应基因通常只在具有相同细胞命运的细胞子集中上调。”
本集团正在进行持续的研究,以了解导致某些细胞有一个命运和其他人具有不同命运的因素。
“如果我们了解有特定特征的特定细胞群细胞,允许它们在其他细胞死亡时才能生存化疗,那么科学家可能会寻找具体瞄准这些细胞的方法,”李说
使其他研究人员提供数据
该研究团队由杨闽康,博士领导,博士,博士学位,是公共卫生学院的生物统计数据副教授,也在在线提供其他研究人员的数据。
例如,其他科学家可以研究单个基因在化疗前后在单个细胞中是如何表达的。以及特定的基因表达如何与化疗剂量或其他基因的表达相关,”康说。“研究人员还可以使用在线工具来测试新的假设和生成新的数据,因此有可能加快未来对DNA损伤反应的研究。”
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