Next-Gen BioInformatics工具可以在没有编程专业知识的情况下实现大数据分析
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德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发的一种新的数据分析工具,包含了一个用户友好的自然语言界面,允许没有生物信息学或编程语言专业知识的生物医学研究人员对大型数据集进行直观的分析。ob欧宝直播nba
开放获取,人工智能(AI)简况程序叫做DRBioright,为所有研究人员提供了较低的障碍,以充分利用现代研究方法中产生的越来越大的数据。本平台的一份报告今天发布癌症细胞。
“我们觉得我们可以通过创建任何研究人员可以使用的工具来改善进行常规生物信息学分析的当前模型,并通过创建任何研究人员可以使用的工具来提高周转时间,”生物信息学和计算生物学教授汉亮。“我们的Drbioright的长期目标是每个研究人员都是一个聪明的合作者。”
现代生物医学研究中使用的高通量技术产生了大型复杂的数据集,提供有关患者,动物模型或正在研究的细ob欧宝直播nba胞系的全面信息。这些可以包括,例如,研究整个遗传信息(基因组学),基因表达(转录组织)或蛋白质表达(蛋白质组学)。
梁解释说,因为这些“组学”数据集是如此复杂,如果没有专门的分析方法,回答特定的生物学问题就很有挑战性。这些分析通常使用用各种编程语言编写的计算机脚本来完成,这需要对编程和生物信息学有一定的了解。
生物信息管理员可以帮助导航和处理这些复杂的数据集,但工作可能是耗时的。因此,研究团队开发了DRBioright,使研究人员能够通过A更轻松地进行他们自己的数据进行常规分析用户友好的与自然语言交互的聊天界面。
以自然语言为导向的计划允许用户提出该计划的问题,仿佛自然地讲,而不是复杂的编程语言,解释了。
学术研究人员可以免费使用DrBioRight。最初,该程序有一些现成的模块来处理最常见的生物信息学问题,并包括一些最常用的公共癌症癌症基因组图谱和癌症细胞系百科全书。
作为对该方法的确认,研究人员使用DrBioRight对一篇经典的癌症基因组学论文进行了重复分析,发现它可以准确地重现以前发表的结果。
由于该程序是由人工智能驱动的,它也有能力从每一个询问中学习,并改进分析,随着时间的推移成为一个更有用的工具。展望未来,研究人员希望改进DrBioRight,使用户能够分析自己的数据集,并允许新模块的开放开发。
Liang说:“随着我们努力改进这个项目,我们也希望其他生物信息学家能够贡献他们的算法,教授bioright博士。”“整个研究界的参与将有助于创造一种工具,更有效地回答复杂的研究问题。”
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