尼日利亚科学家已经确定了SARS-COV-2的七个谱系:为什么重要

尼日利亚科学家已经确定了SARS-COV-2的七个谱系:为什么重要
尼日利亚科学家正在努力了解冠状病毒。信贷:非洲卓越卓越的传染病基因组

到2020年8月的第一周,Covid-19大流行引起了654,000人死亡全世界。在尼日利亚,截至7月28日,有38,945例确诊病例,记录了813例死亡。

大流行击中了非洲大陆最后,这些数字对于大多数国家而言仍然相对较低。但科学家之间存在强烈观点,在大陆上记录的数据是一个低估随着国家与测试斗争。

随着疯狂的工作仍然存在找一个疫苗,像尼日利亚这样的国家继续尽其所能抑制传播

在尼日利亚,这包括来自公共和私营部门和学术界的支持。正在进行的工作的一个例子是正在进行的测试和研究非洲卓越卓越的传染病基因组,救赎者的大学,ede,osun州。该中心一直专注于传染病研究,包括疟疾,兰萨发烧,埃博拉,艾滋病毒,黄热病,以及最近的SARS-COV-2。

尼日利亚记录了它第一属冠状病毒感染2020年2月27日,通过意大利移民,其样本被送到非洲卓越的夜间传染病基因组学科学疾病控制中心的基因组测序中心的基因组。由于这项工作,第一个SARS-COV-2序列数据非洲大陆在2020年3月6日发表。

基因组测序有助于我们了解病毒,其流行病学和进化。在全球范围内,只有一个SARS-COV-2菌株,也与尼日利亚循环的菌株相同。但是,还有更多1,000个谱系这个新的病毒在世界各地的流通中。

谱系分类是基于或将祖先类型连接到后代的遗传学的遗传变异,其不会改变病毒的生理学。

基本上,当发生突变时形成病毒谱系不会改变编码的病毒蛋白。然而,任何导致病毒致病性,毒力或免疫原性变化的突变将成为一种新的菌株。

如果突变会影响免疫系统用于中和病毒的病毒的一部分,那么这成为一种可感染以前感染或接种疫苗的人的菌株。流感病毒发生这种情况,这就是为什么每年季节性流感需要新疫苗。

我们到目前为止确定七在尼日利亚的这些超过1,000个谱系。每个谱系代表来自不同国家的序列。

这些谱系

一些谱系具有重叠的来源。

第一个谱系代表来自中国和全球出口的病毒序列,包括东南亚,日本,韩国,澳大利亚,美国和欧洲。

第二个谱系代表来自意大利爆发的病毒序列。第三个代表一个新的欧洲人。第四个代表英国,冰岛和土耳其的序列。

第五个代表荷兰,土耳其,沙特阿拉伯,埃及,芬兰和英格兰的序列。第六代表荷兰的序列。第七代表来自土耳其,沙特阿拉伯,埃及,芬兰和英格兰的序列。

尼日利亚确定的谱系与世界其他地区所确定的谱系不同,没有报道或到目前为止,尼日利亚独有的谱系。

考虑到社区传输的当前证据,我们将在尼日利亚传播更多序列数据时更新尼日利亚的谱系数量。

跟踪谱系是非常有用的,对于确定病毒如何通过社区或人群传播。这意味着如果出现一个新的应变,科学家将拥有包含它所需的重要信息。这对非洲地区尤为重要,因为如果新的菌株发生更毒性,或者更传播,它会对弱健康系统产生很大的压力。

SARS-COV-2的突变可能意味着什么

SARS-COV-2中的突变可以赋予病毒的优势。例如,具有有利突变的病毒可能更容易地影响人类,从而在人与人之间更容易扩散;它可以不受免疫系统或更多致病性的识别。

最近的报道建议通过突变产生新的SARS-COV-2“菌株”,这些突变具有可能增加大流行严重程度的突变。

一项研究分析了SARS-COV-2的尖峰蛋白中的一组突变,得出的结论是,当从中国传播到欧洲,北美和澳大利亚的病毒时,特定突变增加了频率。作者的结论是,由于突变使病毒更传播,因此频率增加了。

尼日利亚的科学家们在其他地方仔细地跟踪这些发展。有一个趋势在尼日利亚这种穗蛋白突变的数量的增加。

为什么重要

持续监测病毒遗传变化或突变是重要的,因为它提供了有关病毒演化的有价值的信息及其影响。

如果在用于开发疫苗的病毒区域发生突变,则疫苗不会有效。这是流感疫苗的情况发生,因为病毒保持突变成一种新的应变。

我们还不了解SARS-COV-2。我们不知道病毒是否会在沿线中的新菌株变异。如果确实发生,可能需要开发新的疫苗。

没有任何东西可以努力防止病毒变异。他们自然是一种生存战略。当病毒在其DNA或RNA被复制时或由于选择性压力时发生误差时,发生这些突变。

目前,研究人员正在努力确定有多少医学相关的SARS-COV-2株正在流传,以及治疗和疫苗发育的后果是什么。


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引文:尼日利亚科学家已经确定了SARS-COV-2的七个谱系:为什么它是重要的(2020年,9月7日)从HTTPS://MedicalXpress.com/news/2020-09-nigerian-scists-lineages-sars-COV-.html.
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