观察到的COVID-19变异可能有潜在的分子来源

SARS-COV-2, COVID-19
从患者样本中分离的凋亡细胞(绿色)严重感染SARS-COV-2病毒颗粒(黄色)的彩色扫描电子显微镜照片。图片拍摄于马里兰州德特里克堡的NIAID综合研究设施(IRF)。信贷:NIH / NIAID

人们对SARS-CoV-2 (COVID-19大流行背后的病毒)的敏感性不同,并会出现不同程度的发烧、疲劳和呼吸问题——这是该疾病的常见症状。如何解释这种变化呢?

加州大学河滨分校(University of California, Riverside)和南加州大学(University of Southern California)的科学家可能会解开这个谜团。

发表在医学信息学解锁这组研究人员首次表明,观察到的COVID-19变异可能有潜在的分子来源。这一发现有助于制定有效的预防和治疗策略来对抗这种疾病。

“根据生物标志物和个人的分子特征,人们希望能发展得更好负责这项研究的加州大学河滨分校医学院生物医学副教授西卡·郑说:“在监测病毒传播和疾病病理时,要适应这些变化,这有助于指导缓解和治疗方案。”

SARS-COV-2病毒劫持人宿主分子用于融合和病毒复制,攻击人类蜂窝功能。这些人宿主分子集体称为SARS-COV-2宿主基因。研究人员系统地分析了SARS-COV-2宿主基因表达,它们的变化和年龄和性依赖性使用大规模基因组学,转录组学和蛋白质组学。

他们首先发现宿主基因表达的相似性通常与组织对SARS-CoV-2感染的易感性有关。在他们鉴定的人群中,6个表达变化最大的基因中有ACE2、CLEC4G和CLEC4M,已知它们与SARS-CoV-2的刺突蛋白相互作用。这些基因的高表达可能增加感染和出现严重症状的可能性。其他可变基因包括SLC27A2和PKP2,它们都可以抑制病毒复制;以及介导发热反应的PTGS2。研究人员还发现了与这些基因的可变表达相关的遗传变异。

据郑说,这些标记基因的表达谱可能有助于更好地对风险群体进行分类。

他说:“更全面的风险评估可以更好地指导疫苗分发的早期阶段。”“还可以开发包括这些分子标记物的测试,以更好地监测疾病进展。它们还可以用于对患者进行分层,以评估并最终提高治疗效果。”

除了识别最易变异的SARS-CoV-2,研究结果表明遗传和多个SARS-CoV-2感染和症状严重程度的人群差异。

“当然,这些还需要更多的数据来证实。但研究结果表明,大规模eQTL项目对分析COVID-19患者的基因型和转录组具有潜在价值。”

下一步,研究人员计划进一步分析COVID-19患者的大规模基因型和转录组数据,完善结果,提高相关性和准确性。


进一步探索

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更多信息:Liang Chen等,通过SARS-CoV-2宿主基因表达的群体和组织变异了解COVID-19的变异,医学信息学解锁(2020)。DOI: 10.1016 / j.imu.2020.100443
引用:观察到的COVID-19变异可能有潜在的分子来源(2020年10月21日),可于2021年5月19日从//www.puressens.com/news/2020-10-covid-variability-underlying-molecular-sources.html检索
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